Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NEDD8Q15843 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NEDD8Q15843 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms