Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 TGL2YDR058C 981 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 CPR7YJR032W 1182 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 BLS1YLR408C 369 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 YBL096CYBL096C 309 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 RAS1YOR101W 930 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 AKR1YDR264C 2295 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 YHR202WYHR202W 1809 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 CBP2YHL038C 1893 nt2.58□□□□□ -2
ATG39Q06159 RIF1YBR275C 5751 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 CLB3YDL155W 1284 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 TAM41YGR046W 1158 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 SDP1YIL113W 630 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 SWD2YKL018W 990 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 MBR1YKL093W 1020 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 YNL320WYNL320W 855 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 COS1YNL336W 1146 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 CMK1YFR014C 1341 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 YOR365CYOR365C 2112 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 DBP5YOR046C 1449 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 SHQ1YIL104C 1524 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 TOM1YDR457W 9807 nt2.57□□□□□ -2
ATG39Q06159 DUF1YOL087C 3351 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 FMP32YFL046W 624 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 NIT3YLR351C 876 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 INN1YNL152W 1230 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 RPL20BYOR312C 519 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 SUR1YPL057C 1149 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 YSA1YBR111C 696 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 YHR080CYHR080C 4038 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 PLM2YDR501W 1566 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 FLO5YHR211W 3228 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 EXO5YBR163W 1758 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 MDV1YJL112W 2145 nt2.56□□□□□ -2
ATG39Q06159 SRB8YCR081W 4284 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 YGL118CYGL118C 438 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 RPL1BYGL135W 654 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 YHL045WYHL045W 348 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 ARP4YJL081C 1470 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 YJL175WYJL175W 513 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 YMR310CYMR310C 954 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 TAF3YPL011C 1062 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 RPL1AYPL220W 654 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 YPR078CYPR078C 1119 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 SMC2YFR031C 3513 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 ESL1YIL151C 3357 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 CIN8YEL061C 3003 nt2.55□□□□□ -2
ATG39Q06159 MSS4YDR208W 2340 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 UBP14YBR058C 2346 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 ATP25YMR098C 1839 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 YNR063WYNR063W 1824 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 PBI1YPL272C 1554 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 YCR015CYCR015C 954 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 YDL241WYDL241W 372 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 DDI2YFL061W 678 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 RPL30YGL030W 318 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 ADH4YGL256W 1149 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 MTM1YGR257C 1101 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 SDS3YIL084C 984 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 AIM25YJR100C 984 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 GOT1YMR292W 417 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 MDJ2YNL328C 441 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 DDI3YNL335W 678 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 HNT3YOR258W 654 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 YBR089WYBR089W 600 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 KIN82YCR091W 2163 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 REC8YPR007C 2043 nt2.54□□□□□ -2
ATG39Q06159 SPO14YKR031C 5052 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 DNM1YLL001W 2274 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 CEX1YOR112W 2286 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 MRS2YOR334W 1413 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 FLO11YIR019C 4104 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 STE24YJR117W 1362 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 EBS1YDR206W 2655 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 SAP1YER047C 2694 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 MIP6YHR015W 1980 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 YDR222WYDR222W 1248 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 YDR290WYDR290W 330 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 SPT2YER161C 1002 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 ATP12YJL180C 978 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 IME1YJR094C 1083 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 DID4YKL002W 699 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 GTT2YLL060C 702 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 SSN8YNL025C 972 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 YOL024WYOL024W 519 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 GPI2YPL076W 843 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 GRX1YCL035C 333 nt2.53□□□□□ -2
ATG39Q06159 ADY4YLR227C 1482 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 DSS1YMR287C 2910 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 RMD5YDR255C 1266 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 IZH1YDR492W 951 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG39Q06159 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.2 ms