Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	CTF18	YMR078C	2226 nt		2.78	□□□□□ -1.96
MRPS28	P21771	DSN1	YIR010W	1731 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	SRO9	YCL037C	1305 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	ICR1	ICR1	3199 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MMS21	YEL019C	804 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YGL214W	YGL214W	486 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RPS23A	YGR118W	438 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	ERV29	YGR284C	933 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YBR053C	YBR053C	1077 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RPS23B	YPR132W	438 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	NTO1	YPR031W	2247 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	VHR2	YER064C	1518 nt		2.77	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YDR090C	YDR090C	933 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RMT2	YDR465C	1239 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YDR491C	YDR491C	492 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PAU10	YDR542W	363 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	WBP1	YEL002C	1293 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	HYP2	YEL034W	474 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PAU11	YGL261C	363 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PAU13	YHL046C	363 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PAN5	YHR063C	1140 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YKR033C	YKR033C	426 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PAU4	YLR461W	363 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.76	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YAT2	YER024W	2772 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	BUD30	YDL151C	582 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MFA2	YNL145W	117 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	NDJ1	YOL104C	1059 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PHO5	YBR093C	1404 nt		2.75	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	OPI6	YDL096C	327 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	LSM6	YDR378C	261 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	AST2	YER101C	1293 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	GTT1	YIR038C	705 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YJL028W	YJL028W	336 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	SFH5	YJL145W	885 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RRG9	YNL213C	645 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RPL33A	YPL143W	324 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MRPL51	YPR100W	423 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.74	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	GAT2	YMR136W	1683 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YHL012W	YHL012W	1482 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MLH1	YMR167W	2310 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	CLB3	YDL155W	1284 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	SOL3	YHR163W	750 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	CFD1	YIL003W	882 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YKL071W	YKL071W	771 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	BUR2	YLR226W	1188 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RSM19	YNR037C	276 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	DSE3	YOR264W	1293 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	ARG2	YJL071W	1725 nt		2.73	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	MTH1	YDR277C	1302 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RPC11	YDR045C	333 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YDR161W	YDR161W	1164 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YER147C-A	YER147C-A	411 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	CDC26	YFR036W	375 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YVC1	YOR087W	2028 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	YOR314W	YOR314W	330 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	USV1	YPL230W	1176 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	ARO7	YPR060C	771 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	FES1	YBR101C	873 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	BMT2	YBR141C	1014 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	SEC15	YGL233W	2733 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	ILS1	YBL076C	3219 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	PEX6	YNL329C	3093 nt		2.72	□□□□□ -1.97
MRPS28	P21771	RGC1	YPR115W	3252 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	CUE3	YGL110C	1875 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	DSL1	YNL258C	2265 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	ATP25	YMR098C	1839 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	PCL9	YDL179W	915 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	RTN1	YDR233C	888 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	THP2	YHR167W	786 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	YUH1	YJR099W	711 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	YET2	YMR040W	483 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	MIC27	YNL100W	705 nt		2.71	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	PDS1	YDR113C	1122 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	SDP1	YIL113W	630 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	MTR2	YKL186C	555 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	MPP6	YNR024W	561 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	PUF6	YDR496C	1971 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.7	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	MRH1	YDR033W	963 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	PEF1	YGR058W	1008 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	AGE2	YIL044C	897 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	SEC65	YML105C	822 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	MRPL16	YBL038W	699 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	TAF14	YPL129W	735 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	snR42	snR42	351 nt		2.69	□□□□□ -1.98
MRPS28	P21771	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.69	□□□□□ -1.98

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