Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMCO3A2RU48 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMCO3A2RU48 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms