Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms