Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NF2P35240 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NF2P35240 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NF2P35240 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NF2P35240 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NF2P35240 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NF2P35240 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NF2P35240 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NF2P35240 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NF2P35240 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NF2P35240 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NF2P35240 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NF2P35240 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NF2P35240 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms