Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RBM42Q9BTD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RBM42Q9BTD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RBM42Q9BTD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms