Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLMNQ96JQ2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLMNQ96JQ2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms