Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAPC2Q13487 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAPC2Q13487 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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