Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCL2P13500 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL2P13500 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCL2P13500 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCL2P13500 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL2P13500 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL2P13500 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL2P13500 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL2P13500 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms