Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLF9Q13886 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF9Q13886 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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