Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.619e-7■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.584e-22■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.44e-22■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.214e-22■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-9■■■■■ 76.3
SERBP1Q8NC51 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-12■■■■■ 76.2
SERBP1Q8NC51 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 75.9
SERBP1Q8NC51 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 75.1
SERBP1Q8NC51 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 75.1
SERBP1Q8NC51 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.243e-6■■■■■ 73.5
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 320.44■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-208ENST00000418997 996 ntTSL 219.71■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-221ENST00000523131 567 ntTSL 519.54■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-223ENST00000523938 626 ntTSL 519.47■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-210ENST00000437293 701 ntTSL 318.51■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-216ENST00000521309 1399 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-202ENST00000395948 812 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.543e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 73.1
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.447e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-207ENST00000497866 980 ntTSL 228.16■■■□□ 2.17e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.397e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.325e-13■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 221.82■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.997e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.987e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.97e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 520.61■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-204ENST00000453108 702 ntTSL 320.48■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.797e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.787e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 518.03■□□□□ 0.487e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.487e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.447e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-204ENST00000416337 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 317.69■□□□□ 0.427e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 317.47■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 UNC13D-212ENST00000589670 668 ntTSL 316.79■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 B4GALT2-208ENST00000498543 360 ntTSL 316.24■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 UNC13D-206ENST00000586519 403 ntTSL 516.18■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 YIF1B-210ENST00000589151 431 ntTSL 216.08■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.147e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-204ENST00000564161 4654 ntTSL 214.66□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.137e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.157e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.157e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 213.16□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 TLN1-203ENST00000464379 814 ntTSL 313.15□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ZC3H18-210ENST00000567085 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.89□□□□□ -0.517e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.557e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 C7orf71-202ENST00000614528 1963 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 410.41□□□□□ -0.747e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 C7orf71-201ENST00000409974 1956 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 73
SERBP1Q8NC51 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 72.1
SERBP1Q8NC51 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.544e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.354e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.124e-29■■■■■ 71.7
SERBP1Q8NC51 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 518.21■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 71.4
SERBP1Q8NC51 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 71.4
SERBP1Q8NC51 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 71.2
SERBP1Q8NC51 BAG6-262ENST00000470875 1000 ntTSL 521.11■□□□□ 0.979e-8■■■■■ 69.9
SERBP1Q8NC51 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 69.9
SERBP1Q8NC51 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 69.9
SERBP1Q8NC51 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 316.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 214.47□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 69.5
SERBP1Q8NC51 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 511.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 69.5
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