Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncor1Q60974 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ncor1Q60974 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ncor1Q60974 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ncor1Q60974 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncor1Q60974 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncor1Q60974 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncor1Q60974 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ncor1Q60974 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ncor1Q60974 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ncor1Q60974 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ncor1Q60974 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ncor1Q60974 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncor1Q60974 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncor1Q60974 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ncor1Q60974 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ncor1Q60974 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncor1Q60974 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ncor1Q60974 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ncor1Q60974 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ncor1Q60974 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ncor1Q60974 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ncor1Q60974 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ncor1Q60974 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ncor1Q60974 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ncor1Q60974 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ncor1Q60974 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ncor1Q60974 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncor1Q60974 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ncor1Q60974 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncor1Q60974 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ncor1Q60974 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ncor1Q60974 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ncor1Q60974 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ncor1Q60974 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms