Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppp1r1bQ60829 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppp1r1bQ60829 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppp1r1bQ60829 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppp1r1bQ60829 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppp1r1bQ60829 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppp1r1bQ60829 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppp1r1bQ60829 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppp1r1bQ60829 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ppp1r1bQ60829 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ppp1r1bQ60829 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ppp1r1bQ60829 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ppp1r1bQ60829 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ppp1r1bQ60829 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ppp1r1bQ60829 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ppp1r1bQ60829 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ppp1r1bQ60829 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppp1r1bQ60829 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ppp1r1bQ60829 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppp1r1bQ60829 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ppp1r1bQ60829 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppp1r1bQ60829 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms