Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Repin1Q5U4E2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Repin1Q5U4E2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Repin1Q5U4E2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Repin1Q5U4E2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Repin1Q5U4E2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Repin1Q5U4E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Repin1Q5U4E2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Repin1Q5U4E2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Repin1Q5U4E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Repin1Q5U4E2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Repin1Q5U4E2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Repin1Q5U4E2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Repin1Q5U4E2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Repin1Q5U4E2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Repin1Q5U4E2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Repin1Q5U4E2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Repin1Q5U4E2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Repin1Q5U4E2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms