Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 HEL2YDR266C 1920 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 TIR3YIL011W 810 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM13Q12383 CLB6YGR109C 1143 nt8.58□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 MET8YBR213W 825 nt8.57□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 YGL114WYGL114W 2178 nt8.55□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 MUP1YGR055W 1725 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 YJL067WYJL067W 351 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 RTG1YOL067C 534 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 GID7YCL039W 2238 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 YNL115CYNL115C 1935 nt8.52□□□□□ -1.04
TRM13Q12383 PRO1YDR300C 1287 nt8.51□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 VPS75YNL246W 795 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 HOL1YNR055C 1761 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 MET2YNL277W 1461 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 PEX25YPL112C 1185 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 HXT1YHR094C 1713 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 ATG15YCR068W 1563 nt8.48□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 POM34YLR018C 900 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 SHH4YLR164W 507 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 YML089CYML089C 369 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 ILV3YJR016C 1758 nt8.46□□□□□ -1.05
TRM13Q12383 HUA1YGR268C 597 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM13Q12383 YNL024CYNL024C 741 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM13Q12383 DBP1YPL119C 1854 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM13Q12383 DIF1YLR437C 402 nt8.44□□□□□ -1.06
TRM13Q12383 SHY1YGR112W 1170 nt8.41□□□□□ -1.06
TRM13Q12383 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.4□□□□□ -1.06
TRM13Q12383 PAU7YAR020C 168 nt8.38□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 YOR325WYOR325W 474 nt8.37□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 MAE1YKL029C 2010 nt8.36□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 HIS2YFR025C 1008 nt8.36□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 CWC15YDR163W 528 nt8.35□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.35□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 OPI10YOL032W 741 nt8.35□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 PRE6YOL038W 765 nt8.35□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 SFP1YLR403W 2052 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 RET2YFR051C 1641 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 LIP1YMR298W 453 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 NPP1YCR026C 2229 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM13Q12383 COQ8YGL119W 1506 nt8.34□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 SED1YDR077W 1017 nt8.33□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 YFL066CYFL066C 1179 nt8.33□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 URA6YKL024C 615 nt8.33□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 YBL086CYBL086C 1401 nt8.33□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 TOM6YOR045W 186 nt8.33□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 MRP20YDR405W 792 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 BSP1YPR171W 1731 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 YAR028WYAR028W 705 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 SFA1YDL168W 1161 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 CCT2YIL142W 1584 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 SAM1YLR180W 1149 nt8.29□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 YMR209CYMR209C 1374 nt8.29□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 YDR010CYDR010C 333 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 TIF6YPR016C 738 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 UGP1YKL035W 1500 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM13Q12383 UBX6YJL048C 1191 nt8.27□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 REG2YBR050C 1017 nt8.27□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 ARO8YGL202W 1503 nt8.27□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 SHB17YKR043C 816 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 UFO1YML088W 2007 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 KES1YPL145C 1305 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 ESBP6YNL125C 2022 nt8.24□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.24□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 PEX2YJL210W 816 nt8.24□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 PET8YNL003C 855 nt8.24□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 ACO2YJL200C 2370 nt8.24□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 ADO1YJR105W 1023 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 OYE3YPL171C 1203 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 BET2YPR176C 978 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 LEU9YOR108W 1815 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 SGA1YIL099W 1650 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 YFR018CYFR018C 1092 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 TOA2YKL058W 369 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 HIP1YGR191W 1812 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM13Q12383 MET28YIR017C 564 nt8.21□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 ILV2YMR108W 2064 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 MTG2YHR168W 1557 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 Q0010Q0010 387 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 MRPL8YJL063C 717 nt8.19□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 BRR1YPR057W 1026 nt8.19□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 PHO89YBR296C 1725 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 AKR2YOR034C 2250 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 LSB6YJL100W 1824 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 YJR154WYJR154W 1041 nt8.16□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 PSD1YNL169C 1503 nt8.16□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 CYT1YOR065W 930 nt8.16□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 YPL251WYPL251W 303 nt8.16□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 ALP1YNL270C 1722 nt8.15□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 GND2YGR256W 1479 nt8.15□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 SPP2YOR148C 558 nt8.15□□□□□ -1.1
TRM13Q12383 VPS62YGR141W 1404 nt8.14□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 SAM2YDR502C 1155 nt8.13□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 FIT3YOR383C 615 nt8.13□□□□□ -1.11
TRM13Q12383 QDR2YIL121W 1629 nt8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms