Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 TIR3YIL011W 810 nt9.96□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 YDR010CYDR010C 333 nt9.95□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 PAU7YAR020C 168 nt9.95□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 YDR094WYDR094W 336 nt9.94□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 UTR1YJR049C 1593 nt9.93□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 PRO1YDR300C 1287 nt9.93□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 SHB17YKR043C 816 nt9.93□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 ARO7YPR060C 771 nt9.93□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 YAT1YAR035W 2064 nt9.93□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 HIF1YLL022C 1158 nt9.92□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 LSC2YGR244C 1284 nt9.91□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 GAP1YKR039W 1809 nt9.91□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 SFA1YDL168W 1161 nt9.9□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 MIR1YJR077C 936 nt9.9□□□□□ -0.82
TMA46Q12000 POM34YLR018C 900 nt9.89□□□□□ -0.83
TMA46Q12000 ALD4YOR374W 1560 nt9.88□□□□□ -0.83
TMA46Q12000 RRT5YFR032C 870 nt9.87□□□□□ -0.83
TMA46Q12000 PAU16YKL224C 372 nt9.87□□□□□ -0.83
TMA46Q12000 PAB1YER165W 1734 nt9.85□□□□□ -0.83
TMA46Q12000 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.84□□□□□ -0.83
TMA46Q12000 TOM6YOR045W 186 nt9.83□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 ATG15YCR068W 1563 nt9.83□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 RET2YFR051C 1641 nt9.82□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 NDI1YML120C 1542 nt9.82□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 UBA4YHR111W 1323 nt9.82□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 UBX6YJL048C 1191 nt9.81□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.8□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 PHO89YBR296C 1725 nt9.79□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.79□□□□□ -0.84
TMA46Q12000 THI74YDR438W 1113 nt9.77□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 YML089CYML089C 369 nt9.77□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 DIF1YLR437C 402 nt9.75□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 HEL2YDR266C 1920 nt9.75□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 PEX2YJL210W 816 nt9.74□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 SAM35YHR083W 990 nt9.73□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 COQ2YNR041C 1119 nt9.73□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 YSR3YKR053C 1215 nt9.72□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 TIF6YPR016C 738 nt9.72□□□□□ -0.85
TMA46Q12000 HIP1YGR191W 1812 nt9.7□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 SPT20YOL148C 1815 nt9.69□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 RPC82YPR190C 1965 nt9.69□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 XYL2YLR070C 1071 nt9.68□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 DBP1YPL119C 1854 nt9.68□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 MSF1YPR047W 1410 nt9.67□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 NAT4YMR069W 858 nt9.66□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 ZRT3YKL175W 1512 nt9.66□□□□□ -0.86
TMA46Q12000 INA1YLR413W 2028 nt9.65□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 HXT1YHR094C 1713 nt9.64□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 MRP20YDR405W 792 nt9.63□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YGL034CYGL034C 366 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YJL067WYJL067W 351 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.62□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YCR087WYCR087W 516 nt9.6□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 SHY1YGR112W 1170 nt9.59□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 MET28YIR017C 564 nt9.59□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YAR028WYAR028W 705 nt9.59□□□□□ -0.87
TMA46Q12000 YBL086CYBL086C 1401 nt9.58□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 MTG2YHR168W 1557 nt9.58□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 NRT1YOR071C 1797 nt9.57□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 LIP1YMR298W 453 nt9.56□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 AIM45YPR004C 1035 nt9.56□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 ZTA1YBR046C 1005 nt9.55□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 RPL4BYDR012W 1089 nt9.54□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 SED1YDR077W 1017 nt9.54□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 UTH1YKR042W 1098 nt9.54□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 RPL4AYBR031W 1089 nt9.54□□□□□ -0.88
TMA46Q12000 YGL114WYGL114W 2178 nt9.52□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 RPS14BYJL191W 417 nt9.52□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 RIM8YGL045W 1629 nt9.52□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 AKR2YOR034C 2250 nt9.51□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 LCP5YER127W 1074 nt9.51□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.51□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 RBG1YAL036C 1110 nt9.49□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 RSC4YKR008W 1878 nt9.49□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 REG2YBR050C 1017 nt9.48□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 YPL251WYPL251W 303 nt9.48□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 UFO1YML088W 2007 nt9.48□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 URH1YDR400W 1023 nt9.47□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 LEU9YOR108W 1815 nt9.47□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 ALP1YNL270C 1722 nt9.46□□□□□ -0.89
TMA46Q12000 FIT3YOR383C 615 nt9.45□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 MUP1YGR055W 1725 nt9.45□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 BSP1YPR171W 1731 nt9.45□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 COG1YGL223C 1254 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 SBA1YKL117W 651 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 YLR122CYLR122C 378 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 SAM1YLR180W 1149 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 YPL041CYPL041C 624 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 BRR1YPR057W 1026 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 MAS1YLR163C 1389 nt9.44□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 MAE1YKL029C 2010 nt9.43□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 URA6YKL024C 615 nt9.43□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 TOA2YKL058W 369 nt9.43□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 ARA2YMR041C 1008 nt9.43□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 YJL118WYJL118W 660 nt9.42□□□□□ -0.9
TMA46Q12000 YOR325WYOR325W 474 nt9.41□□□□□ -0.9
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