Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YDR010CYDR010C 333 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 PRE6YOL038W 765 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 NME1NME1 340 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 ATG15YCR068W 1563 nt10.04□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 RRT5YFR032C 870 nt10.03□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 SHB17YKR043C 816 nt10.03□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 ZRT3YKL175W 1512 nt10.02□□□□□ -0.8
VHS3Q08438 INA1YLR413W 2028 nt10.02□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 RET2YFR051C 1641 nt10□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 SFA1YDL168W 1161 nt9.99□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 YDR094WYDR094W 336 nt9.99□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 SPT20YOL148C 1815 nt9.98□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 MIR1YJR077C 936 nt9.97□□□□□ -0.81
VHS3Q08438 DIF1YLR437C 402 nt9.96□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 TOM6YOR045W 186 nt9.96□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 UBA4YHR111W 1323 nt9.93□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 PHO89YBR296C 1725 nt9.92□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 RPC82YPR190C 1965 nt9.92□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 HSL7YBR133C 2484 nt9.9□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 DBP1YPL119C 1854 nt9.9□□□□□ -0.82
VHS3Q08438 HXT1YHR094C 1713 nt9.9□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 TIF6YPR016C 738 nt9.89□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 YCR087WYCR087W 516 nt9.87□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 THI74YDR438W 1113 nt9.87□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 PEX2YJL210W 816 nt9.86□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 YSR3YKR053C 1215 nt9.86□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 HIP1YGR191W 1812 nt9.86□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 MRP20YDR405W 792 nt9.85□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 MET28YIR017C 564 nt9.85□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 PAU16YKL224C 372 nt9.85□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 YJL067WYJL067W 351 nt9.84□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 YAR028WYAR028W 705 nt9.84□□□□□ -0.83
VHS3Q08438 COQ2YNR041C 1119 nt9.83□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 SHY1YGR112W 1170 nt9.81□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 SED1YDR077W 1017 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 LIP1YMR298W 453 nt9.8□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 CLB6YGR109C 1143 nt9.79□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 NAT4YMR069W 858 nt9.79□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 UTH1YKR042W 1098 nt9.78□□□□□ -0.84
VHS3Q08438 NRT1YOR071C 1797 nt9.77□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 MSF1YPR047W 1410 nt9.76□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 RPL4BYDR012W 1089 nt9.76□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 RPL4AYBR031W 1089 nt9.76□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YBL086CYBL086C 1401 nt9.75□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 FIT3YOR383C 615 nt9.75□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 URA6YKL024C 615 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 XYL2YLR070C 1071 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 MTG2YHR168W 1557 nt9.74□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 HEL2YDR266C 1920 nt9.73□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 AIM45YPR004C 1035 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 ALP1YNL270C 1722 nt9.72□□□□□ -0.85
VHS3Q08438 YGL034CYGL034C 366 nt9.71□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 LEU9YOR108W 1815 nt9.7□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 SAM1YLR180W 1149 nt9.7□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 AKR2YOR034C 2250 nt9.68□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 ILV3YJR016C 1758 nt9.68□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 UBX6YJL048C 1191 nt9.67□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 RPS14BYJL191W 417 nt9.67□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 UFO1YML088W 2007 nt9.65□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 BRR1YPR057W 1026 nt9.65□□□□□ -0.86
VHS3Q08438 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.64□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 TOA2YKL058W 369 nt9.64□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 MUP1YGR055W 1725 nt9.64□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 CWC15YDR163W 528 nt9.63□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 PET8YNL003C 855 nt9.63□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 ZTA1YBR046C 1005 nt9.63□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 OYE3YPL171C 1203 nt9.61□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 YPL251WYPL251W 303 nt9.61□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 HOL1YNR055C 1761 nt9.6□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 MET2YNL277W 1461 nt9.6□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 YNL024CYNL024C 741 nt9.6□□□□□ -0.87
VHS3Q08438 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.58□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 OPI10YOL032W 741 nt9.57□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 YOR325WYOR325W 474 nt9.57□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 GND2YGR256W 1479 nt9.56□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 TSC10YBR265W 963 nt9.56□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 RIM8YGL045W 1629 nt9.56□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 YGL114WYGL114W 2178 nt9.56□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 RBG1YAL036C 1110 nt9.54□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 MEP3YPR138C 1470 nt9.53□□□□□ -0.88
VHS3Q08438 SBA1YKL117W 651 nt9.52□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 YMR103CYMR103C 363 nt9.52□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 BSP1YPR171W 1731 nt9.51□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 CCT2YIL142W 1584 nt9.51□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 SAM2YDR502C 1155 nt9.51□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 OXA1YER154W 1209 nt9.49□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 SEC61YLR378C 1443 nt9.48□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 YLR279WYLR279W 390 nt9.48□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 COQ8YGL119W 1506 nt9.47□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 APT2YDR441C 546 nt9.47□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 HIS2YFR025C 1008 nt9.47□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 VPS62YGR141W 1404 nt9.47□□□□□ -0.89
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