Protein–RNA interactions for Protein: Q08219

RRT8, Outer spore wall protein RRT8, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT8Q08219 CMP2YML057W 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
RRT8Q08219 UTR1YJR049C 1593 nt9.35□□□□□ -0.91
RRT8Q08219 ATG15YCR068W 1563 nt9.34□□□□□ -0.91
RRT8Q08219 MIR1YJR077C 936 nt9.34□□□□□ -0.91
RRT8Q08219 YAT1YAR035W 2064 nt9.34□□□□□ -0.91
RRT8Q08219 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.33□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 PAU16YKL224C 372 nt9.33□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 HIF1YLL022C 1158 nt9.33□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 POM34YLR018C 900 nt9.32□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 RET2YFR051C 1641 nt9.31□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 YML089CYML089C 369 nt9.31□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 UBA4YHR111W 1323 nt9.31□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 GID7YCL039W 2238 nt9.3□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 SFA1YDL168W 1161 nt9.3□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 PHO89YBR296C 1725 nt9.3□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 THI74YDR438W 1113 nt9.29□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 TOM6YOR045W 186 nt9.28□□□□□ -0.92
RRT8Q08219 UBX6YJL048C 1191 nt9.26□□□□□ -0.93
RRT8Q08219 YSR3YKR053C 1215 nt9.26□□□□□ -0.93
RRT8Q08219 NAT4YMR069W 858 nt9.25□□□□□ -0.93
RRT8Q08219 NDI1YML120C 1542 nt9.22□□□□□ -0.93
RRT8Q08219 YCR087WYCR087W 516 nt9.21□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 MRP20YDR405W 792 nt9.21□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 PEX2YJL210W 816 nt9.2□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 DIF1YLR437C 402 nt9.2□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 ESBP6YNL125C 2022 nt9.19□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 MSF1YPR047W 1410 nt9.19□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 COQ2YNR041C 1119 nt9.18□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 ZRT3YKL175W 1512 nt9.17□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 HSL7YBR133C 2484 nt9.16□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 XYL2YLR070C 1071 nt9.16□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 TIF6YPR016C 738 nt9.16□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 HIP1YGR191W 1812 nt9.15□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 INA1YLR413W 2028 nt9.15□□□□□ -0.94
RRT8Q08219 HXT1YHR094C 1713 nt9.14□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 YGL034CYGL034C 366 nt9.13□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 CLB6YGR109C 1143 nt9.13□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 MET28YIR017C 564 nt9.13□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 YAR028WYAR028W 705 nt9.11□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 SPT20YOL148C 1815 nt9.1□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 NRT1YOR071C 1797 nt9.1□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 RPL4BYDR012W 1089 nt9.1□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 UTH1YKR042W 1098 nt9.1□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 RPL4AYBR031W 1089 nt9.1□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 DBP1YPL119C 1854 nt9.09□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 AIM45YPR004C 1035 nt9.09□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 RPC82YPR190C 1965 nt9.09□□□□□ -0.95
RRT8Q08219 LIP1YMR298W 453 nt9.08□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 SED1YDR077W 1017 nt9.07□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 RFC1YOR217W 2586 nt9.04□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 YJL067WYJL067W 351 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 FIT3YOR383C 615 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.03□□□□□ -0.96
RRT8Q08219 SHY1YGR112W 1170 nt9.02□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 RBG1YAL036C 1110 nt9.02□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 MTG2YHR168W 1557 nt9.02□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 AKR2YOR034C 2250 nt9.02□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 RPS14BYJL191W 417 nt9.01□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 ALP1YNL270C 1722 nt9.01□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 YBL086CYBL086C 1401 nt9□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 SAM1YLR180W 1149 nt9□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 DTR1YBR180W 1719 nt9□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 NPP1YCR026C 2229 nt8.99□□□□□ -0.97
RRT8Q08219 TOA2YKL058W 369 nt8.96□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 ZTA1YBR046C 1005 nt8.96□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 ILV2YMR108W 2064 nt8.95□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.94□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 BRR1YPR057W 1026 nt8.94□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 HEM14YER014W 1620 nt8.94□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 URA6YKL024C 615 nt8.93□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 LEU9YOR108W 1815 nt8.92□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 SDH5YOL071W 489 nt8.92□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 TSC10YBR265W 963 nt8.92□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 CWC15YDR163W 528 nt8.9□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 YPL251WYPL251W 303 nt8.9□□□□□ -0.98
RRT8Q08219 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.89□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.89□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 RIM8YGL045W 1629 nt8.89□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 GND2YGR256W 1479 nt8.89□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 MCM5YLR274W 2328 nt8.88□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 HEL2YDR266C 1920 nt8.88□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 PET8YNL003C 855 nt8.88□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 SFP1YLR403W 2052 nt8.88□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 UFO1YML088W 2007 nt8.88□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 OYE3YPL171C 1203 nt8.87□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 MUP1YGR055W 1725 nt8.87□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 MEP3YPR138C 1470 nt8.87□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 SAM2YDR502C 1155 nt8.86□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.85□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 SBA1YKL117W 651 nt8.85□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 YMR103CYMR103C 363 nt8.85□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 YGR012WYGR012W 1182 nt8.84□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.84□□□□□ -0.99
RRT8Q08219 YLR279WYLR279W 390 nt8.83□□□□□ -1
RRT8Q08219 MET2YNL277W 1461 nt8.83□□□□□ -1
RRT8Q08219 YNL024CYNL024C 741 nt8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.5 ms