Protein–RNA interactions for Protein: Q05919

VPS38, Vacuolar protein sorting-associated protein 38, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS38Q05919 SFA1YDL168W 1161 nt10.69□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.68□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 SAM35YHR083W 990 nt10.68□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 MIR1YJR077C 936 nt10.66□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 YML089CYML089C 369 nt10.66□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 YDR094WYDR094W 336 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 RRT5YFR032C 870 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 TOM6YOR045W 186 nt10.65□□□□□ -0.7
VPS38Q05919 RET2YFR051C 1641 nt10.63□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 INA1YLR413W 2028 nt10.62□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 DIF1YLR437C 402 nt10.61□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 RPC82YPR190C 1965 nt10.61□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 SPT20YOL148C 1815 nt10.6□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 UBA4YHR111W 1323 nt10.59□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 ZRT3YKL175W 1512 nt10.59□□□□□ -0.71
VPS38Q05919 PHO89YBR296C 1725 nt10.58□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 PAU16YKL224C 372 nt10.57□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 PEX2YJL210W 816 nt10.55□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 DBP1YPL119C 1854 nt10.54□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 TIF6YPR016C 738 nt10.54□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 THI74YDR438W 1113 nt10.53□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 HXT1YHR094C 1713 nt10.53□□□□□ -0.72
VPS38Q05919 YSR3YKR053C 1215 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 COQ2YNR041C 1119 nt10.51□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 HIP1YGR191W 1812 nt10.5□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 YJL067WYJL067W 351 nt10.5□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 HSL7YBR133C 2484 nt10.48□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.46□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.46□□□□□ -0.73
VPS38Q05919 MRP20YDR405W 792 nt10.45□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 SHY1YGR112W 1170 nt10.45□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YAR028WYAR028W 705 nt10.45□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.44□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 MET28YIR017C 564 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 UBX6YJL048C 1191 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 XYL2YLR070C 1071 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 LIP1YMR298W 453 nt10.43□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YCR087WYCR087W 516 nt10.42□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 NAT4YMR069W 858 nt10.42□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 YBL086CYBL086C 1401 nt10.41□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 MSF1YPR047W 1410 nt10.41□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 SED1YDR077W 1017 nt10.4□□□□□ -0.74
VPS38Q05919 MTG2YHR168W 1557 nt10.39□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 NRT1YOR071C 1797 nt10.39□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 YGL034CYGL034C 366 nt10.37□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 UTH1YKR042W 1098 nt10.36□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 RPL4BYDR012W 1089 nt10.35□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 RPL4AYBR031W 1089 nt10.35□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 CLB6YGR109C 1143 nt10.34□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 ZTA1YBR046C 1005 nt10.34□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 AIM45YPR004C 1035 nt10.34□□□□□ -0.75
VPS38Q05919 AKR2YOR034C 2250 nt10.33□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 URA6YKL024C 615 nt10.32□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 LEU9YOR108W 1815 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 SAM1YLR180W 1149 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 UFO1YML088W 2007 nt10.31□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 ALP1YNL270C 1722 nt10.3□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 RPS14BYJL191W 417 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 FIT3YOR383C 615 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 BRR1YPR057W 1026 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 MUP1YGR055W 1725 nt10.29□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 TOA2YKL058W 369 nt10.28□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 YPL251WYPL251W 303 nt10.28□□□□□ -0.76
VPS38Q05919 HOL1YNR055C 1761 nt10.27□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 YOR325WYOR325W 474 nt10.27□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 ILV3YJR016C 1758 nt10.26□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 RPM1RPM1 483 nt10.26□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.25□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 YNL024CYNL024C 741 nt10.25□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 CWC15YDR163W 528 nt10.24□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 OYE3YPL171C 1203 nt10.24□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 SBA1YKL117W 651 nt10.23□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 GND2YGR256W 1479 nt10.23□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 RBG1YAL036C 1110 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 RIM8YGL045W 1629 nt10.22□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 PET8YNL003C 855 nt10.21□□□□□ -0.77
VPS38Q05919 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.19□□□□□ -0.78
VPS38Q05919 YMR103CYMR103C 363 nt10.19□□□□□ -0.78
VPS38Q05919 MEP3YPR138C 1470 nt10.18□□□□□ -0.78
VPS38Q05919 OPI10YOL032W 741 nt10.16□□□□□ -0.78
VPS38Q05919 YGL114WYGL114W 2178 nt10.15□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 CCT2YIL142W 1584 nt10.14□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 TSC10YBR265W 963 nt10.13□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 YLR279WYLR279W 390 nt10.12□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 FMS1YMR020W 1527 nt10.12□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 SPP2YOR148C 558 nt10.11□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 SAM2YDR502C 1155 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 COQ8YGL119W 1506 nt10.1□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 ACH1YBL015W 1581 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 ARO8YGL202W 1503 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 UGA4YDL210W 1716 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 HEL2YDR266C 1920 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 RSC8YFR037C 1674 nt10.09□□□□□ -0.79
VPS38Q05919 FLR1YBR008C 1647 nt10.08□□□□□ -0.8
VPS38Q05919 MSB4YOL112W 1479 nt10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.2 ms