Protein–RNA interactions for Protein: Q01448

HPC2, Histone promoter control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HPC2Q01448 UTH1YKR042W 1098 nt12.34□□□□□ -0.43
HPC2Q01448 TSC10YBR265W 963 nt12.34□□□□□ -0.43
HPC2Q01448 YGR012WYGR012W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 GUT2YIL155C 1950 nt12.32□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 BOP3YNL042W 1191 nt12.31□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 PAC11YDR488C 1602 nt12.3□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 GOR1YNL274C 1053 nt12.3□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 Q0010Q0010 387 nt12.3□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 REG2YBR050C 1017 nt12.28□□□□□ -0.44
HPC2Q01448 ESS1YJR017C 513 nt12.27□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 ADH1YOL086C 1047 nt12.27□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 YEL008WYEL008W 381 nt12.22□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 TIR3YIL011W 810 nt12.22□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 HIP1YGR191W 1812 nt12.21□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 CPD1YGR247W 720 nt12.21□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 GPN2YOR262W 1044 nt12.21□□□□□ -0.45
HPC2Q01448 RTF1YGL244W 1677 nt12.2□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.19□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 SHH4YLR164W 507 nt12.19□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 NRT1YOR071C 1797 nt12.18□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 YPI1YFR003C 468 nt12.18□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 TOM6YOR045W 186 nt12.18□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 PEX2YJL210W 816 nt12.15□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 FRE6YLL051C 2139 nt12.15□□□□□ -0.46
HPC2Q01448 NBP35YGL091C 987 nt12.14□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 NAP1YKR048C 1254 nt12.14□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 DUT1YBR252W 444 nt12.14□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 POM34YLR018C 900 nt12.12□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.12□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 YML089CYML089C 369 nt12.11□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 PUP1YOR157C 786 nt12.11□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 PIB2YGL023C 1908 nt12.11□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 MET28YIR017C 564 nt12.09□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 YJL225CYJL225C 5277 nt12.09□□□□□ -0.47
HPC2Q01448 SEN2YLR105C 1134 nt12.08□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 MSB4YOL112W 1479 nt12.08□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 AGP1YCL025C 1902 nt12.07□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 ARA2YMR041C 1008 nt12.07□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.05□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.05□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 PAM17YKR065C 594 nt12.04□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 TIF6YPR016C 738 nt12.04□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 LSC2YGR244C 1284 nt12.03□□□□□ -0.48
HPC2Q01448 FIT3YOR383C 615 nt12.02□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 PAB1YER165W 1734 nt12.02□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 LOT5YKL183W 921 nt12.01□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 YLR122CYLR122C 378 nt12.01□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 GND1YHR183W 1470 nt12.01□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 PTK1YKL198C 1989 nt12□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 PRO1YDR300C 1287 nt11.97□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 AAC1YMR056C 930 nt11.97□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 LCP5YER127W 1074 nt11.96□□□□□ -0.49
HPC2Q01448 URH1YDR400W 1023 nt11.95□□□□□ -0.5
HPC2Q01448 CCA1YER168C 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
HPC2Q01448 ATG15YCR068W 1563 nt11.92□□□□□ -0.5
HPC2Q01448 YBR232CYBR232C 360 nt11.89□□□□□ -0.51
HPC2Q01448 PGC1YPL206C 966 nt11.88□□□□□ -0.51
HPC2Q01448 APT2YDR441C 546 nt11.86□□□□□ -0.51
HPC2Q01448 TOM20YGR082W 552 nt11.85□□□□□ -0.51
HPC2Q01448 YFL054CYFL054C 1941 nt11.84□□□□□ -0.51
HPC2Q01448 YJR114WYJR114W 393 nt11.84□□□□□ -0.51
HPC2Q01448 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.82□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 ABZ2YMR289W 1125 nt11.82□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 TIM44YIL022W 1296 nt11.81□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 STR3YGL184C 1398 nt11.8□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 YJL064WYJL064W 396 nt11.8□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 STP3YLR375W 1032 nt11.8□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 PAU5YFL020C 369 nt11.79□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 SMM1YNR015W 1155 nt11.79□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 YJL118WYJL118W 660 nt11.78□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 AQY2YLL052C 450 nt11.78□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.78□□□□□ -0.52
HPC2Q01448 PAU19YMR325W 375 nt11.77□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 ARP6YLR085C 1317 nt11.76□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 RIB2YOL066C 1776 nt11.76□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 DUS1YML080W 1272 nt11.74□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 NVJ2YPR091C 2313 nt11.74□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 ALP1YNL270C 1722 nt11.73□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 GAP1YKR039W 1809 nt11.72□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 FCY21YER060W 1587 nt11.72□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 HXT12YIL170W 1374 nt11.71□□□□□ -0.53
HPC2Q01448 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.71□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.71□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 COG1YGL223C 1254 nt11.68□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 SLG1YOR008C 1137 nt11.68□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 YAR028WYAR028W 705 nt11.67□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 RIB1YBL033C 1038 nt11.67□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 ZTA1YBR046C 1005 nt11.66□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 ALD4YOR374W 1560 nt11.66□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 SWE1YJL187C 2460 nt11.65□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 YPL041CYPL041C 624 nt11.65□□□□□ -0.54
HPC2Q01448 BUR6YER159C 429 nt11.63□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 MTG2YHR168W 1557 nt11.62□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 YCL074WYCL074W 927 nt11.62□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 AKR2YOR034C 2250 nt11.62□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 DIF1YLR437C 402 nt11.61□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 CCT5YJR064W 1689 nt11.6□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.6□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 PRY1YJL079C 900 nt11.59□□□□□ -0.55
HPC2Q01448 FTH1YBR207W 1398 nt11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.1 ms