Protein–RNA interactions for Protein: P53146

USE1, Protein transport protein USE1, yeastyeast

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USE1P53146 YJL067WYJL067W 351 nt9.75□□□□□ -0.85
USE1P53146 ATG15YCR068W 1563 nt9.71□□□□□ -0.86
USE1P53146 MUP1YGR055W 1725 nt9.7□□□□□ -0.86
USE1P53146 DIF1YLR437C 402 nt9.69□□□□□ -0.86
USE1P53146 DBP1YPL119C 1854 nt9.69□□□□□ -0.86
USE1P53146 SFA1YDL168W 1161 nt9.68□□□□□ -0.86
USE1P53146 YDR010CYDR010C 333 nt9.68□□□□□ -0.86
USE1P53146 RIM8YGL045W 1629 nt9.67□□□□□ -0.86
USE1P53146 HOL1YNR055C 1761 nt9.67□□□□□ -0.86
USE1P53146 HEL2YDR266C 1920 nt9.66□□□□□ -0.86
USE1P53146 HXT1YHR094C 1713 nt9.65□□□□□ -0.86
USE1P53146 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.65□□□□□ -0.86
USE1P53146 MRPL8YJL063C 717 nt9.65□□□□□ -0.86
USE1P53146 TOM6YOR045W 186 nt9.65□□□□□ -0.86
USE1P53146 YFR018CYFR018C 1092 nt9.64□□□□□ -0.87
USE1P53146 YML089CYML089C 369 nt9.64□□□□□ -0.87
USE1P53146 PRE6YOL038W 765 nt9.64□□□□□ -0.87
USE1P53146 SHY1YGR112W 1170 nt9.63□□□□□ -0.87
USE1P53146 ADO1YJR105W 1023 nt9.63□□□□□ -0.87
USE1P53146 PAU7YAR020C 168 nt9.62□□□□□ -0.87
USE1P53146 YGL114WYGL114W 2178 nt9.61□□□□□ -0.87
USE1P53146 RET2YFR051C 1641 nt9.61□□□□□ -0.87
USE1P53146 SHB17YKR043C 816 nt9.61□□□□□ -0.87
USE1P53146 YOR325WYOR325W 474 nt9.59□□□□□ -0.87
USE1P53146 YBL086CYBL086C 1401 nt9.57□□□□□ -0.88
USE1P53146 TIF6YPR016C 738 nt9.57□□□□□ -0.88
USE1P53146 ILV3YJR016C 1758 nt9.56□□□□□ -0.88
USE1P53146 YNL024CYNL024C 741 nt9.56□□□□□ -0.88
USE1P53146 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.55□□□□□ -0.88
USE1P53146 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.55□□□□□ -0.88
USE1P53146 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.55□□□□□ -0.88
USE1P53146 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.55□□□□□ -0.88
USE1P53146 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.55□□□□□ -0.88
USE1P53146 PEX2YJL210W 816 nt9.54□□□□□ -0.88
USE1P53146 LIP1YMR298W 453 nt9.52□□□□□ -0.89
USE1P53146 MIR1YJR077C 936 nt9.51□□□□□ -0.89
USE1P53146 HIP1YGR191W 1812 nt9.5□□□□□ -0.89
USE1P53146 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.5□□□□□ -0.89
USE1P53146 YAR028WYAR028W 705 nt9.49□□□□□ -0.89
USE1P53146 UFO1YML088W 2007 nt9.49□□□□□ -0.89
USE1P53146 PHO89YBR296C 1725 nt9.48□□□□□ -0.89
USE1P53146 SED1YDR077W 1017 nt9.48□□□□□ -0.89
USE1P53146 URA6YKL024C 615 nt9.48□□□□□ -0.89
USE1P53146 UBA4YHR111W 1323 nt9.47□□□□□ -0.89
USE1P53146 MTG2YHR168W 1557 nt9.46□□□□□ -0.89
USE1P53146 COQ2YNR041C 1119 nt9.45□□□□□ -0.9
USE1P53146 LEU9YOR108W 1815 nt9.45□□□□□ -0.9
USE1P53146 MRP20YDR405W 792 nt9.44□□□□□ -0.9
USE1P53146 OPI10YOL032W 741 nt9.44□□□□□ -0.9
USE1P53146 COQ8YGL119W 1506 nt9.44□□□□□ -0.9
USE1P53146 CWC15YDR163W 528 nt9.43□□□□□ -0.9
USE1P53146 ZTA1YBR046C 1005 nt9.42□□□□□ -0.9
USE1P53146 YPL251WYPL251W 303 nt9.42□□□□□ -0.9
USE1P53146 ARO8YGL202W 1503 nt9.41□□□□□ -0.9
USE1P53146 UGP1YKL035W 1500 nt9.41□□□□□ -0.9
USE1P53146 MET28YIR017C 564 nt9.41□□□□□ -0.9
USE1P53146 SAM1YLR180W 1149 nt9.41□□□□□ -0.9
USE1P53146 CCT2YIL142W 1584 nt9.41□□□□□ -0.9
USE1P53146 OYE3YPL171C 1203 nt9.39□□□□□ -0.91
USE1P53146 BRR1YPR057W 1026 nt9.39□□□□□ -0.91
USE1P53146 MAE1YKL029C 2010 nt9.39□□□□□ -0.91
USE1P53146 AKR2YOR034C 2250 nt9.38□□□□□ -0.91
USE1P53146 RRT5YFR032C 870 nt9.38□□□□□ -0.91
USE1P53146 TOA2YKL058W 369 nt9.38□□□□□ -0.91
USE1P53146 LSB6YJL100W 1824 nt9.38□□□□□ -0.91
USE1P53146 YSR3YKR053C 1215 nt9.37□□□□□ -0.91
USE1P53146 YMR209CYMR209C 1374 nt9.37□□□□□ -0.91
USE1P53146 GND2YGR256W 1479 nt9.36□□□□□ -0.91
USE1P53146 KES1YPL145C 1305 nt9.35□□□□□ -0.91
USE1P53146 HIS2YFR025C 1008 nt9.35□□□□□ -0.91
USE1P53146 PET8YNL003C 855 nt9.35□□□□□ -0.91
USE1P53146 NRT1YOR071C 1797 nt9.35□□□□□ -0.91
USE1P53146 ACH1YBL015W 1581 nt9.34□□□□□ -0.91
USE1P53146 THI74YDR438W 1113 nt9.34□□□□□ -0.91
USE1P53146 BET2YPR176C 978 nt9.34□□□□□ -0.91
USE1P53146 SGA1YIL099W 1650 nt9.33□□□□□ -0.92
USE1P53146 SBA1YKL117W 651 nt9.33□□□□□ -0.92
USE1P53146 ALP1YNL270C 1722 nt9.33□□□□□ -0.92
USE1P53146 FMS1YMR020W 1527 nt9.32□□□□□ -0.92
USE1P53146 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.32□□□□□ -0.92
USE1P53146 PAU16YKL224C 372 nt9.32□□□□□ -0.92
USE1P53146 YDR094WYDR094W 336 nt9.31□□□□□ -0.92
USE1P53146 XYL2YLR070C 1071 nt9.31□□□□□ -0.92
USE1P53146 UTH1YKR042W 1098 nt9.3□□□□□ -0.92
USE1P53146 YMR103CYMR103C 363 nt9.3□□□□□ -0.92
USE1P53146 ZAP1YJL056C 2643 nt9.3□□□□□ -0.92
USE1P53146 SPP2YOR148C 558 nt9.29□□□□□ -0.92
USE1P53146 FLR1YBR008C 1647 nt9.28□□□□□ -0.92
USE1P53146 YCR087WYCR087W 516 nt9.28□□□□□ -0.92
USE1P53146 RSC8YFR037C 1674 nt9.27□□□□□ -0.93
USE1P53146 RPL4BYDR012W 1089 nt9.27□□□□□ -0.93
USE1P53146 RPL4AYBR031W 1089 nt9.27□□□□□ -0.93
USE1P53146 MEP3YPR138C 1470 nt9.27□□□□□ -0.93
USE1P53146 ACO2YJL200C 2370 nt9.27□□□□□ -0.93
USE1P53146 RPS14BYJL191W 417 nt9.26□□□□□ -0.93
USE1P53146 FIT3YOR383C 615 nt9.26□□□□□ -0.93
USE1P53146 YPS3YLR121C 1527 nt9.26□□□□□ -0.93
USE1P53146 CLB6YGR109C 1143 nt9.24□□□□□ -0.93
USE1P53146 RPM1RPM1 483 nt9.24□□□□□ -0.93
USE1P53146 AIM45YPR004C 1035 nt9.24□□□□□ -0.93
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