Protein–RNA interactions for Protein: P53088

NCS6, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCS6P53088 YPI1YFR003C 468 nt11.26□□□□□ -0.61
NCS6P53088 UTH1YKR042W 1098 nt11.26□□□□□ -0.61
NCS6P53088 TIM44YIL022W 1296 nt11.23□□□□□ -0.61
NCS6P53088 BNA2YJR078W 1362 nt11.22□□□□□ -0.61
NCS6P53088 RIB1YBL033C 1038 nt11.16□□□□□ -0.62
NCS6P53088 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.15□□□□□ -0.62
NCS6P53088 YCR102CYCR102C 1107 nt11.14□□□□□ -0.63
NCS6P53088 NVJ2YPR091C 2313 nt11.13□□□□□ -0.63
NCS6P53088 YGR201CYGR201C 678 nt11.13□□□□□ -0.63
NCS6P53088 YJL064WYJL064W 396 nt11.13□□□□□ -0.63
NCS6P53088 AVT6YER119C 1347 nt11.12□□□□□ -0.63
NCS6P53088 MIC12YBR262C 321 nt11.12□□□□□ -0.63
NCS6P53088 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.11□□□□□ -0.63
NCS6P53088 YBR232CYBR232C 360 nt11.11□□□□□ -0.63
NCS6P53088 BMT6YLR063W 1098 nt11.1□□□□□ -0.63
NCS6P53088 NRT1YOR071C 1797 nt11.1□□□□□ -0.63
NCS6P53088 HHO1YPL127C 777 nt11.09□□□□□ -0.63
NCS6P53088 PGC1YPL206C 966 nt11.09□□□□□ -0.63
NCS6P53088 ERG6YML008C 1152 nt11.08□□□□□ -0.64
NCS6P53088 SLG1YOR008C 1137 nt11.08□□□□□ -0.64
NCS6P53088 PAU5YFL020C 369 nt11.07□□□□□ -0.64
NCS6P53088 PAU19YMR325W 375 nt11.07□□□□□ -0.64
NCS6P53088 AAC1YMR056C 930 nt11.06□□□□□ -0.64
NCS6P53088 YFL054CYFL054C 1941 nt11.05□□□□□ -0.64
NCS6P53088 LOT5YKL183W 921 nt11.04□□□□□ -0.64
NCS6P53088 STP3YLR375W 1032 nt11.04□□□□□ -0.64
NCS6P53088 GOR1YNL274C 1053 nt11.04□□□□□ -0.64
NCS6P53088 HIP1YGR191W 1812 nt11.03□□□□□ -0.64
NCS6P53088 PEX2YJL210W 816 nt11.03□□□□□ -0.64
NCS6P53088 TOM6YOR045W 186 nt11.03□□□□□ -0.64
NCS6P53088 GND1YHR183W 1470 nt11.01□□□□□ -0.65
NCS6P53088 MSB4YOL112W 1479 nt11.01□□□□□ -0.65
NCS6P53088 SOD2YHR008C 702 nt11.01□□□□□ -0.65
NCS6P53088 PAC11YDR488C 1602 nt11□□□□□ -0.65
NCS6P53088 YIA6YIL006W 1122 nt10.97□□□□□ -0.65
NCS6P53088 TIR3YIL011W 810 nt10.97□□□□□ -0.65
NCS6P53088 RAX1YOR301W 1308 nt10.96□□□□□ -0.65
NCS6P53088 MET28YIR017C 564 nt10.96□□□□□ -0.65
NCS6P53088 SHH4YLR164W 507 nt10.96□□□□□ -0.65
NCS6P53088 QDR2YIL121W 1629 nt10.94□□□□□ -0.66
NCS6P53088 APT2YDR441C 546 nt10.92□□□□□ -0.66
NCS6P53088 YML089CYML089C 369 nt10.91□□□□□ -0.66
NCS6P53088 POM34YLR018C 900 nt10.89□□□□□ -0.67
NCS6P53088 FIT3YOR383C 615 nt10.89□□□□□ -0.67
NCS6P53088 DUT1YBR252W 444 nt10.87□□□□□ -0.67
NCS6P53088 AGP1YCL025C 1902 nt10.87□□□□□ -0.67
NCS6P53088 TIP1YBR067C 633 nt10.86□□□□□ -0.67
NCS6P53088 SWE1YJL187C 2460 nt10.85□□□□□ -0.67
NCS6P53088 TIF6YPR016C 738 nt10.85□□□□□ -0.67
NCS6P53088 NBP35YGL091C 987 nt10.84□□□□□ -0.67
NCS6P53088 POP2YNR052C 1302 nt10.83□□□□□ -0.68
NCS6P53088 RIB2YOL066C 1776 nt10.81□□□□□ -0.68
NCS6P53088 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.8□□□□□ -0.68
NCS6P53088 CCA1YER168C 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
NCS6P53088 SMM1YNR015W 1155 nt10.78□□□□□ -0.68
NCS6P53088 YER152W-AYER152W-A 567 nt10.76□□□□□ -0.69
NCS6P53088 PRO1YDR300C 1287 nt10.75□□□□□ -0.69
NCS6P53088 LSC2YGR244C 1284 nt10.75□□□□□ -0.69
NCS6P53088 ATG15YCR068W 1563 nt10.73□□□□□ -0.69
NCS6P53088 ALD4YOR374W 1560 nt10.73□□□□□ -0.69
NCS6P53088 BUD20YLR074C 501 nt10.7□□□□□ -0.7
NCS6P53088 PAR32YDL173W 888 nt10.65□□□□□ -0.7
NCS6P53088 HXT12YIL170W 1374 nt10.65□□□□□ -0.71
NCS6P53088 CCT5YJR064W 1689 nt10.63□□□□□ -0.71
NCS6P53088 TAF13YML098W 504 nt10.63□□□□□ -0.71
NCS6P53088 VRG4YGL225W 1014 nt10.62□□□□□ -0.71
NCS6P53088 YCP4YCR004C 744 nt10.6□□□□□ -0.71
NCS6P53088 FCY21YER060W 1587 nt10.59□□□□□ -0.71
NCS6P53088 ALP1YNL270C 1722 nt10.58□□□□□ -0.72
NCS6P53088 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.56□□□□□ -0.72
NCS6P53088 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.56□□□□□ -0.72
NCS6P53088 STR3YGL184C 1398 nt10.54□□□□□ -0.72
NCS6P53088 THI72YOR192C 1800 nt10.54□□□□□ -0.72
NCS6P53088 PRY1YJL079C 900 nt10.51□□□□□ -0.73
NCS6P53088 KRE1YNL322C 942 nt10.51□□□□□ -0.73
NCS6P53088 TOS1YBR162C 1368 nt10.51□□□□□ -0.73
NCS6P53088 SAM50YNL026W 1455 nt10.5□□□□□ -0.73
NCS6P53088 AQY2YLL052C 450 nt10.49□□□□□ -0.73
NCS6P53088 YMR262WYMR262W 942 nt10.49□□□□□ -0.73
NCS6P53088 ZTA1YBR046C 1005 nt10.49□□□□□ -0.73
NCS6P53088 TUB4YLR212C 1422 nt10.49□□□□□ -0.73
NCS6P53088 FUR4YBR021W 1902 nt10.48□□□□□ -0.73
NCS6P53088 AKR2YOR034C 2250 nt10.48□□□□□ -0.73
NCS6P53088 DUS1YML080W 1272 nt10.48□□□□□ -0.73
NCS6P53088 YJL055WYJL055W 738 nt10.47□□□□□ -0.73
NCS6P53088 YAR028WYAR028W 705 nt10.47□□□□□ -0.73
NCS6P53088 GAP1YKR039W 1809 nt10.46□□□□□ -0.74
NCS6P53088 GSF2YML048W 1212 nt10.44□□□□□ -0.74
NCS6P53088 RPL12BYDR418W 498 nt10.42□□□□□ -0.74
NCS6P53088 MTG2YHR168W 1557 nt10.41□□□□□ -0.74
NCS6P53088 ARP6YLR085C 1317 nt10.4□□□□□ -0.74
NCS6P53088 YCL074WYCL074W 927 nt10.4□□□□□ -0.74
NCS6P53088 YOR268CYOR268C 399 nt10.38□□□□□ -0.75
NCS6P53088 HSP60YLR259C 1719 nt10.36□□□□□ -0.75
NCS6P53088 POT1YIL160C 1254 nt10.36□□□□□ -0.75
NCS6P53088 MFG1YDL233W 1377 nt10.36□□□□□ -0.75
NCS6P53088 DIF1YLR437C 402 nt10.34□□□□□ -0.75
NCS6P53088 YOR343CYOR343C 327 nt10.34□□□□□ -0.75
NCS6P53088 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.32□□□□□ -0.76
NCS6P53088 MHF1YOL086W-A 273 nt10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.1 ms