Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lbx1P52955 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lbx1P52955 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lbx1P52955 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lbx1P52955 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lbx1P52955 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lbx1P52955 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lbx1P52955 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lbx1P52955 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lbx1P52955 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lbx1P52955 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lbx1P52955 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lbx1P52955 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lbx1P52955 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lbx1P52955 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lbx1P52955 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lbx1P52955 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lbx1P52955 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lbx1P52955 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lbx1P52955 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lbx1P52955 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lbx1P52955 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lbx1P52955 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lbx1P52955 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lbx1P52955 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms