Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defa-rs7P50715 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defa-rs7P50715 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa-rs7P50715 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa-rs7P50715 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa-rs7P50715 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa-rs7P50715 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa-rs7P50715 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa-rs7P50715 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa-rs7P50715 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa-rs7P50715 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa-rs7P50715 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa-rs7P50715 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Defa-rs7P50715 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Defa-rs7P50715 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms