Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 MSF1YPR047W 1410 nt9.96□□□□□ -0.82
SEC28P40509 PRO1YDR300C 1287 nt9.95□□□□□ -0.82
SEC28P40509 GAP1YKR039W 1809 nt9.95□□□□□ -0.82
SEC28P40509 ATG15YCR068W 1563 nt9.94□□□□□ -0.82
SEC28P40509 YCR087WYCR087W 516 nt9.93□□□□□ -0.82
SEC28P40509 SFA1YDL168W 1161 nt9.92□□□□□ -0.82
SEC28P40509 POM34YLR018C 900 nt9.92□□□□□ -0.82
SEC28P40509 YML089CYML089C 369 nt9.92□□□□□ -0.82
SEC28P40509 NAR1YNL240C 1476 nt9.91□□□□□ -0.82
SEC28P40509 MRP20YDR405W 792 nt9.91□□□□□ -0.82
SEC28P40509 SAM35YHR083W 990 nt9.9□□□□□ -0.82
SEC28P40509 TOM6YOR045W 186 nt9.89□□□□□ -0.83
SEC28P40509 PRM5YIL117C 957 nt9.88□□□□□ -0.83
SEC28P40509 UTR1YJR049C 1593 nt9.88□□□□□ -0.83
SEC28P40509 SSN3YPL042C 1668 nt9.87□□□□□ -0.83
SEC28P40509 XYL2YLR070C 1071 nt9.87□□□□□ -0.83
SEC28P40509 YGL034CYGL034C 366 nt9.86□□□□□ -0.83
SEC28P40509 ALD4YOR374W 1560 nt9.84□□□□□ -0.83
SEC28P40509 COQ2YNR041C 1119 nt9.84□□□□□ -0.83
SEC28P40509 PEX2YJL210W 816 nt9.83□□□□□ -0.84
SEC28P40509 CLB6YGR109C 1143 nt9.81□□□□□ -0.84
SEC28P40509 CYT2YKL087C 675 nt9.81□□□□□ -0.84
SEC28P40509 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.8□□□□□ -0.84
SEC28P40509 AIM45YPR004C 1035 nt9.8□□□□□ -0.84
SEC28P40509 HIF1YLL022C 1158 nt9.79□□□□□ -0.84
SEC28P40509 PBP1YGR178C 2169 nt9.79□□□□□ -0.84
SEC28P40509 RPL4BYDR012W 1089 nt9.77□□□□□ -0.85
SEC28P40509 RPL4AYBR031W 1089 nt9.77□□□□□ -0.85
SEC28P40509 HIP1YGR191W 1812 nt9.77□□□□□ -0.85
SEC28P40509 RBG1YAL036C 1110 nt9.76□□□□□ -0.85
SEC28P40509 UTH1YKR042W 1098 nt9.76□□□□□ -0.85
SEC28P40509 TIF6YPR016C 738 nt9.76□□□□□ -0.85
SEC28P40509 MET28YIR017C 564 nt9.75□□□□□ -0.85
SEC28P40509 DIF1YLR437C 402 nt9.75□□□□□ -0.85
SEC28P40509 NRT1YOR071C 1797 nt9.75□□□□□ -0.85
SEC28P40509 NDI1YML120C 1542 nt9.7□□□□□ -0.86
SEC28P40509 YAR028WYAR028W 705 nt9.69□□□□□ -0.86
SEC28P40509 RPS14BYJL191W 417 nt9.66□□□□□ -0.86
SEC28P40509 FIT3YOR383C 615 nt9.66□□□□□ -0.86
SEC28P40509 HXT1YHR094C 1713 nt9.65□□□□□ -0.86
SEC28P40509 GID7YCL039W 2238 nt9.65□□□□□ -0.86
SEC28P40509 BSP1YPR171W 1731 nt9.64□□□□□ -0.87
SEC28P40509 ZRT3YKL175W 1512 nt9.63□□□□□ -0.87
SEC28P40509 SDH5YOL071W 489 nt9.63□□□□□ -0.87
SEC28P40509 SED1YDR077W 1017 nt9.62□□□□□ -0.87
SEC28P40509 LIP1YMR298W 453 nt9.62□□□□□ -0.87
SEC28P40509 AKR2YOR034C 2250 nt9.61□□□□□ -0.87
SEC28P40509 ALP1YNL270C 1722 nt9.6□□□□□ -0.87
SEC28P40509 DBP1YPL119C 1854 nt9.59□□□□□ -0.87
SEC28P40509 MTG2YHR168W 1557 nt9.58□□□□□ -0.88
SEC28P40509 TSC10YBR265W 963 nt9.58□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.57□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.57□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.57□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.57□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.57□□□□□ -0.88
SEC28P40509 SAM1YLR180W 1149 nt9.55□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YAT1YAR035W 2064 nt9.55□□□□□ -0.88
SEC28P40509 INA1YLR413W 2028 nt9.55□□□□□ -0.88
SEC28P40509 ZTA1YBR046C 1005 nt9.54□□□□□ -0.88
SEC28P40509 YBL086CYBL086C 1401 nt9.52□□□□□ -0.89
SEC28P40509 GLR1YPL091W 1452 nt9.52□□□□□ -0.89
SEC28P40509 SHY1YGR112W 1170 nt9.51□□□□□ -0.89
SEC28P40509 TOA2YKL058W 369 nt9.51□□□□□ -0.89
SEC28P40509 CMP2YML057W 1815 nt9.5□□□□□ -0.89
SEC28P40509 YGR012WYGR012W 1182 nt9.5□□□□□ -0.89
SEC28P40509 YLR111WYLR111W 333 nt9.49□□□□□ -0.89
SEC28P40509 BRR1YPR057W 1026 nt9.48□□□□□ -0.89
SEC28P40509 NPP1YCR026C 2229 nt9.47□□□□□ -0.89
SEC28P40509 YLR279WYLR279W 390 nt9.47□□□□□ -0.89
SEC28P40509 YJL067WYJL067W 351 nt9.46□□□□□ -0.9
SEC28P40509 MET2YNL277W 1461 nt9.45□□□□□ -0.9
SEC28P40509 HSL7YBR133C 2484 nt9.45□□□□□ -0.9
SEC28P40509 LEU9YOR108W 1815 nt9.44□□□□□ -0.9
SEC28P40509 ESBP6YNL125C 2022 nt9.44□□□□□ -0.9
SEC28P40509 SFP1YLR403W 2052 nt9.44□□□□□ -0.9
SEC28P40509 RAD23YEL037C 1197 nt9.43□□□□□ -0.9
SEC28P40509 YPL251WYPL251W 303 nt9.43□□□□□ -0.9
SEC28P40509 MSB4YOL112W 1479 nt9.42□□□□□ -0.9
SEC28P40509 MEP3YPR138C 1470 nt9.42□□□□□ -0.9
SEC28P40509 URA6YKL024C 615 nt9.42□□□□□ -0.9
SEC28P40509 GND2YGR256W 1479 nt9.41□□□□□ -0.9
SEC28P40509 SPT20YOL148C 1815 nt9.41□□□□□ -0.9
SEC28P40509 SAM2YDR502C 1155 nt9.41□□□□□ -0.9
SEC28P40509 SBA1YKL117W 651 nt9.4□□□□□ -0.9
SEC28P40509 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.4□□□□□ -0.9
SEC28P40509 HEL2YDR266C 1920 nt9.4□□□□□ -0.9
SEC28P40509 RPC82YPR190C 1965 nt9.39□□□□□ -0.91
SEC28P40509 YMR103CYMR103C 363 nt9.39□□□□□ -0.91
SEC28P40509 PET8YNL003C 855 nt9.39□□□□□ -0.91
SEC28P40509 CWC15YDR163W 528 nt9.38□□□□□ -0.91
SEC28P40509 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.38□□□□□ -0.91
SEC28P40509 OYE3YPL171C 1203 nt9.38□□□□□ -0.91
SEC28P40509 YMR226CYMR226C 804 nt9.37□□□□□ -0.91
SEC28P40509 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.37□□□□□ -0.91
SEC28P40509 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.37□□□□□ -0.91
SEC28P40509 YMR244WYMR244W 1068 nt9.36□□□□□ -0.91
SEC28P40509 UFO1YML088W 2007 nt9.36□□□□□ -0.91
SEC28P40509 UGA4YDL210W 1716 nt9.32□□□□□ -0.92
SEC28P40509 APT2YDR441C 546 nt9.31□□□□□ -0.92
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