Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS4Q9NQG7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS4Q9NQG7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms