Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.887e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 HDHD3-203ENST00000485934 913 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.94e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.946e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.014e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.034e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-204ENST00000412285 5271 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 AKR1B10-202ENST00000475559 869 ntTSL 58.18□□□□□ -1.16e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 57.9□□□□□ -1.144e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.174e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.184e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MYO18A-201ENST00000527312 573 ntTSL 26.35□□□□□ -1.394e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MYO18A-211ENST00000531438 565 ntTSL 46.18□□□□□ -1.424e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SLC23A2-203ENST00000423430 911 ntTSL 56.13□□□□□ -1.434e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.774e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 33.8□□□□□ -1.84e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-213ENST00000496750 649 ntTSL 33.68□□□□□ -1.824e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-218ENST00000641360 3897 nt3.2□□□□□ -1.94e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.83□□□□□ -0.684e-9■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-11■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 510.39□□□□□ -0.752e-11■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 29□□□□□ -0.973e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.123e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.23e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 37.51□□□□□ -1.213e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 57.51□□□□□ -1.213e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 NHSL1-201ENST00000342260 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.09□□□□□ -1.273e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.293e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.351e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 55.76□□□□□ -1.493e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.4□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 35.33□□□□□ -1.561e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.743e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.263e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-213ENST00000482806 1826 ntTSL 514.94□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 314.63□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-209ENST00000480955 894 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-204ENST00000464101 570 ntTSL 213.87□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 213.56□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 513.11□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-214ENST00000505777 576 ntTSL 413.07□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-207ENST00000495889 543 ntTSL 310.48□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 510.28□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 39.48□□□□□ -0.891e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 49.44□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-205ENST00000468022 662 ntTSL 59.43□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-205ENST00000466961 819 ntTSL 38.94□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 48.56□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 58.54□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-203ENST00000451793 856 ntTSL 28.19□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-206ENST00000470412 986 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 46.84□□□□□ -1.311e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -21e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-209ENST00000483002 585 ntTSL 410.28□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-202ENST00000412256 558 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-10■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 310.28□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 59.74□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.948e-30■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.398e-30■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.188e-30■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.817e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.47e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 517.14■□□□□ 0.337e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 316.28■□□□□ 0.27e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.197e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.187e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 516.13■□□□□ 0.177e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.177e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 215.92■□□□□ 0.147e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 215.26■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.06■□□□□ 07e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 314.44□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 214.44□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.177e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 213.79□□□□□ -0.27e-6■□□□□ 8.2
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