Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCEQ02156 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCEQ02156 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms