Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NOP58Q9Y2X3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NOP58Q9Y2X3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms