Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCLK3Q9C098 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLK3Q9C098 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms