Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GNB1P62873 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GNB1P62873 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GNB1P62873 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GNB1P62873 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GNB1P62873 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB1P62873 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB1P62873 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB1P62873 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB1P62873 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB1P62873 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB1P62873 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms