Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCE1P61221 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCE1P61221 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms