Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR13-206ENST00000479279 2486 ntTSL 1 (best)21.69■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NBPF1-206ENST00000599069 2752 ntTSL 1 (best)20.92■□□□□ 0.941e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HGFAC-202ENST00000506132 743 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 219.84■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SLC2A9-206ENST00000505104 1659 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 CARS-204ENST00000439280 1021 ntTSL 319.63■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FAM20A-202ENST00000375556 2081 ntTSL 219■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 USP8-208ENST00000559329 1917 ntTSL 1 (best)18.52■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-217ENST00000570061 674 ntTSL 418.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 218.5■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-206ENST00000474486 2396 ntTSL 218.33■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LPCAT4-205ENST00000563748 1357 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HEXA-202ENST00000563762 1174 ntTSL 218.09■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DYRK1B-206ENST00000600611 657 ntTSL 518.08■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-203ENST00000465512 669 ntTSL 218.08■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 EEFSEC-204ENST00000484438 640 ntTSL 317.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-214ENST00000568068 561 ntTSL 217.52■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MED20-202ENST00000394251 531 ntTSL 417.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-204ENST00000468803 424 ntTSL 216.98■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 GTPBP1-203ENST00000458073 1350 ntTSL 516.85■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 ANXA2-226ENST00000559818 878 ntTSL 516.79■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TAB1-204ENST00000473491 574 ntTSL 416.65■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HEXA-211ENST00000567411 1743 ntTSL 516.59■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-208ENST00000472213 822 ntTSL 316.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MED20-207ENST00000482361 1481 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 F10-207ENST00000498455 849 ntTSL 216.33■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-213ENST00000566859 589 ntTSL 516.23■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 F10-204ENST00000410083 1211 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-209ENST00000492577 717 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-208ENST00000492482 1120 ntTSL 315.96■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 CARS-207ENST00000465331 583 ntTSL 315.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 F10-205ENST00000477269 907 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NMRAL2P-203ENST00000422108 571 ntTSL 415.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LTBR-213ENST00000544454 632 ntTSL 515.51■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HEXA-208ENST00000567027 1353 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 WDR13-207ENST00000482760 562 ntTSL 315.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 GTPBP1-210ENST00000484971 582 ntTSL 315.28■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PPP2R2A-206ENST00000518254 755 ntTSL 515.27■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 515.27■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -01e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOR1A-204ENST00000474192 947 ntTSL 314.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HEXA-207ENST00000566672 1397 ntTSL 214.85□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NTAN1-206ENST00000567030 454 ntTSL 214.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MED20-206ENST00000467535 2602 ntTSL 214.46□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NBPF1-204ENST00000432949 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 CARS-213ENST00000527330 564 ntTSL 414.41□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 MVP-206ENST00000563558 548 ntTSL 414.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 CARS-211ENST00000524825 550 ntTSL 414.34□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-9■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 FBXO25-201ENST00000276326 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 28.8
U2AF2P26368 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 363.1 ms