Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SETD1BQ9UPS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SETD1BQ9UPS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SETD1BQ9UPS6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms