Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KDM4AO75164 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
KDM4AO75164 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KDM4AO75164 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms