Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NPIPA5E9PKD4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms