Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BHLHA9Q7RTU4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHA9Q7RTU4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHA9Q7RTU4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms