Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXBP1Q9Y5B6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms