Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF479Q96JC4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms