Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIN3BO75182 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIN3BO75182 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms