Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS9D1Q9Y2B5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS9D1Q9Y2B5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS9D1Q9Y2B5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms