Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 ERG7YHR072W 2196 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YCR085WYCR085W 354 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YDL186WYDL186W 834 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 BMH2YDR099W 822 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SPG1YGR236C 288 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YJR011CYJR011C 786 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 THI11YJR156C 1023 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 AUR1YKL004W 1206 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SHP1YBL058W 1272 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YNL320WYNL320W 855 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MPP6YNR024W 561 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 ARG1YOL058W 1263 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YOR114WYOR114W 885 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MPD1YOR288C 957 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 CPA1YOR303W 1236 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MRPL37YBR268W 318 nt5.87□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF3Q07807 ORC5YNL261W 1440 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MAD3YJL013C 1548 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 STL1YDR536W 1710 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SAG1YJR004C 1953 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 UTP9YHR196W 1728 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 TBF1YPL128C 1689 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YER084W-AYER084W-A 513 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 RPL24BYGR148C 468 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 BUD19YJL188C 309 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 EMG1YLR186W 759 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 GSP1YLR293C 660 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 TEM1YML064C 738 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SPC29YPL124W 762 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YBR116CYBR116C 528 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 BUL1YMR275C 2931 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SSK1YLR006C 2139 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 BZZ1YHR114W 1902 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 GPA2YER020W 1350 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 PPH3YDR075W 927 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YGR219WYGR219W 342 nt5.85□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF3Q07807 BOS1YLR078C 735 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 PET123YOR158W 957 nt5.85□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF3Q07807 TUM1YOR251C 915 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 MUM2YBR057C 1101 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 ICS2YBR157C 768 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 ALT1YLR089C 1779 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 AIM10YER087W 1731 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 FUM1YPL262W 1467 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 snR84snR84 550 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YDR157WYDR157W 402 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SFH5YJL145W 885 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SNO4YMR322C 714 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 RHO2YNL090W 579 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 IAH1YOR126C 717 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 HSP33YOR391C 714 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 HSP32YPL280W 714 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 YPR172WYPR172W 603 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF3Q07807 SPO23YBR250W 1572 nt5.84□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 TEF1YPR080W 1377 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 TEF2YBR118W 1377 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 COS7YDL248W 1152 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 TDA10YGR205W 873 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 COS5YJR161C 1152 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SWD2YKL018W 990 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 TRK2YKR050W 2670 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 ERG9YHR190W 1335 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 GLE2YER107C 1098 nt5.82□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 NSA2YER126C 786 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 NFU1YKL040C 771 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RIF2YLR453C 1188 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 COS3YML132W 1140 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 HSH49YOR319W 642 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 PEP4YPL154C 1218 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YPL205CYPL205C 345 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 ALG14YBR070C 714 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 COS2YBR302C 1140 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 KAR4YCL055W 1008 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 BAP2YBR068C 1830 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 TOS4YLR183C 1470 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 PUT1YLR142W 1431 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 FLC3YGL139W 2409 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 EIS1YMR031C 2532 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YDR154CYDR154C 351 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YDR396WYDR396W 501 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SEH1YGL100W 1050 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 PDE1YGL248W 1110 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RTA1YGR213C 954 nt5.81□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF3Q07807 COX6YHR051W 447 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YIL060WYIL060W 435 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 RHO4YKR055W 876 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YBL077WYBL077W 432 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 UAF30YOR295W 687 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YPR015CYPR015C 744 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 YPR078CYPR078C 1119 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 SNT2YGL131C 4212 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 AI4Q0065 1671 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF3Q07807 UTP18YJL069C 1785 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.3 ms