Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC3A2P08195 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC3A2P08195 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC3A2P08195 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC3A2P08195 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC3A2P08195 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms