Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC7A4O43246 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms