Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 FMP45YDL222C 930 nt10.11□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 ERV46YAL042W 1248 nt10.11□□□□□ -0.79 RIP-Chip
NOP56Q12460 YPR011CYPR011C 981 nt10.11□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 FUR4YBR021W 1902 nt10.11□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 DPS1YLL018C 1674 nt10.1□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 YGL114WYGL114W 2178 nt10.1□□□□□ -0.79 RIP-Chip
NOP56Q12460 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.09□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 YEL076CYEL076C 651 nt10.09□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 YLR464WYLR464W 651 nt10.09□□□□□ -0.79
NOP56Q12460 GTB1YDR221W 2109 nt10.08□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 BMT6YLR063W 1098 nt10.08□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 NME1NME1 340 nt10.08□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 PCM1YEL058W 1674 nt10.07□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 YKR040CYKR040C 504 nt10.07□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 BIO4YNR057C 714 nt10.07□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 FMT1YBL013W 1206 nt10.05□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 YCL042WYCL042W 360 nt10.05□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 SOR2YDL246C 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 SOR1YJR159W 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 LPX1YOR084W 1164 nt10.04□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 MXR2YCL033C 507 nt10.04□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 GAL2YLR081W 1725 nt10.03□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 ACO2YJL200C 2370 nt10.03□□□□□ -0.8
NOP56Q12460 SNF6YHL025W 999 nt10.02□□□□□ -0.81
NOP56Q12460 CWP1YKL096W 720 nt10.02□□□□□ -0.81
NOP56Q12460 RFC1YOR217W 2586 nt10.01□□□□□ -0.81
NOP56Q12460 SPT20YOL148C 1815 nt10□□□□□ -0.81
NOP56Q12460 SIM1YIL123W 1431 nt10□□□□□ -0.81 RIP-Chip
NOP56Q12460 ADH2YMR303C 1047 nt9.99□□□□□ -0.81
NOP56Q12460 GPI16YHR188C 1833 nt9.95□□□□□ -0.82 RIP-Chip
NOP56Q12460 SNF1YDR477W 1902 nt9.95□□□□□ -0.82
NOP56Q12460 THI72YOR192C 1800 nt9.94□□□□□ -0.82
NOP56Q12460 FRD1YEL047C 1413 nt9.94□□□□□ -0.82
NOP56Q12460 YIH1YCR059C 777 nt9.9□□□□□ -0.82
NOP56Q12460 LYS4YDR234W 2082 nt9.89□□□□□ -0.83
NOP56Q12460 RNQ1YCL028W 1218 nt9.88□□□□□ -0.83
NOP56Q12460 TOK1YJL093C 2076 nt9.87□□□□□ -0.83
NOP56Q12460 ERF2YLR246W 1080 nt9.86□□□□□ -0.83
NOP56Q12460 YKR005CYKR005C 1578 nt9.82□□□□□ -0.84
NOP56Q12460 IRC24YIR036C 792 nt9.8□□□□□ -0.84
NOP56Q12460 YLL053CYLL053C 459 nt9.8□□□□□ -0.84
NOP56Q12460 HEM14YER014W 1620 nt9.79□□□□□ -0.84
NOP56Q12460 CRR1YLR213C 1269 nt9.79□□□□□ -0.84
NOP56Q12460 DIC1YLR348C 897 nt9.79□□□□□ -0.84
NOP56Q12460 YLR235CYLR235C 399 nt9.77□□□□□ -0.85
NOP56Q12460 YFL067WYFL067W 528 nt9.75□□□□□ -0.85
NOP56Q12460 NRT1YOR071C 1797 nt9.74□□□□□ -0.85
NOP56Q12460 FTR1YER145C 1215 nt9.74□□□□□ -0.85 RIP-Chip
NOP56Q12460 AQY1YPR192W 918 nt9.72□□□□□ -0.85
NOP56Q12460 HEM12YDR047W 1089 nt9.7□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.7□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 SPP1YPL138C 1062 nt9.7□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 WSC2YNL283C 1512 nt9.7□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 CCA1YER168C 1641 nt9.7□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 MUP1YGR055W 1725 nt9.69□□□□□ -0.86 RIP-Chip
NOP56Q12460 ATF2YGR177C 1608 nt9.69□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 GAL1YBR020W 1587 nt9.69□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 HXK1YFR053C 1458 nt9.68□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 YGR259CYGR259C 441 nt9.68□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 PTH1YHR189W 573 nt9.68□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 DDR2YOL052C-A 186 nt9.68□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 YHL008CYHL008C 1884 nt9.68□□□□□ -0.86 RIP-Chip
NOP56Q12460 TRM5YHR070W 1500 nt9.66□□□□□ -0.86 RIP-Chip
NOP56Q12460 TIM23YNR017W 669 nt9.66□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 RAX1YOR301W 1308 nt9.65□□□□□ -0.86
NOP56Q12460 YKL030WYKL030W 606 nt9.64□□□□□ -0.87
NOP56Q12460 INA1YLR413W 2028 nt9.63□□□□□ -0.87 RIP-Chip
NOP56Q12460 RPC82YPR190C 1965 nt9.63□□□□□ -0.87
NOP56Q12460 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.62□□□□□ -0.87
NOP56Q12460 YLR179CYLR179C 606 nt9.62□□□□□ -0.87
NOP56Q12460 MIC10YCL057C-A 294 nt9.6□□□□□ -0.87
NOP56Q12460 ALD5YER073W 1563 nt9.59□□□□□ -0.87
NOP56Q12460 STB1YNL309W 1263 nt9.58□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 ANP1YEL036C 1503 nt9.57□□□□□ -0.88 RIP-Chip
NOP56Q12460 SPC25YER018C 666 nt9.57□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.56□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 YCL074WYCL074W 927 nt9.55□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 BNA2YJR078W 1362 nt9.54□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 AHT1YHR093W 549 nt9.54□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 YPR064WYPR064W 420 nt9.54□□□□□ -0.88
NOP56Q12460 FRA1YLL029W 2250 nt9.52□□□□□ -0.89
NOP56Q12460 FEN2YCR028C 1539 nt9.51□□□□□ -0.89
NOP56Q12460 MTO1YGL236C 2010 nt9.49□□□□□ -0.89
NOP56Q12460 RSC4YKR008W 1878 nt9.49□□□□□ -0.89
NOP56Q12460 RTG1YOL067C 534 nt9.48□□□□□ -0.89 RIP-Chip
NOP56Q12460 CCT4YDL143W 1587 nt9.48□□□□□ -0.89
NOP56Q12460 DUS1YML080W 1272 nt9.47□□□□□ -0.89
NOP56Q12460 TAD3YLR316C 969 nt9.46□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 MIC12YBR262C 321 nt9.46□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 TPN1YGL186C 1740 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 ILV3YJR016C 1758 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 TOM71YHR117W 1920 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 VPS60YDR486C 690 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 SWC5YBR231C 912 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 YMR209CYMR209C 1374 nt9.45□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 MRPL8YJL063C 717 nt9.43□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 HUA1YGR268C 597 nt9.42□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 YIR016WYIR016W 798 nt9.42□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 NSG2YNL156C 900 nt9.42□□□□□ -0.9
NOP56Q12460 MEP3YPR138C 1470 nt9.41□□□□□ -0.9 RIP-Chip
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