Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 SOR2YDL246C 1074 nt10.32□□□□□ -0.76
HER1Q12276 SOR1YJR159W 1074 nt10.32□□□□□ -0.76
HER1Q12276 YCL042WYCL042W 360 nt10.32□□□□□ -0.76
HER1Q12276 DPS1YLL018C 1674 nt10.31□□□□□ -0.76
HER1Q12276 RAX1YOR301W 1308 nt10.3□□□□□ -0.76
HER1Q12276 HEM12YDR047W 1089 nt10.27□□□□□ -0.77
HER1Q12276 BMT6YLR063W 1098 nt10.27□□□□□ -0.77
HER1Q12276 MIC10YCL057C-A 294 nt10.25□□□□□ -0.77
HER1Q12276 YIH1YCR059C 777 nt10.22□□□□□ -0.77
HER1Q12276 YLL053CYLL053C 459 nt10.21□□□□□ -0.77
HER1Q12276 ATF2YGR177C 1608 nt10.19□□□□□ -0.78
HER1Q12276 SNG1YGR197C 1644 nt10.19□□□□□ -0.78
HER1Q12276 YKR005CYKR005C 1578 nt10.19□□□□□ -0.78
HER1Q12276 BIO5YNR056C 1686 nt10.18□□□□□ -0.78
HER1Q12276 YFL067WYFL067W 528 nt10.16□□□□□ -0.78
HER1Q12276 SNF1YDR477W 1902 nt10.15□□□□□ -0.78
HER1Q12276 YDR094WYDR094W 336 nt10.15□□□□□ -0.78
HER1Q12276 HUA1YGR268C 597 nt10.15□□□□□ -0.78
HER1Q12276 RNQ1YCL028W 1218 nt10.15□□□□□ -0.78
HER1Q12276 PTH1YHR189W 573 nt10.12□□□□□ -0.79
HER1Q12276 WSC2YNL283C 1512 nt10.12□□□□□ -0.79
HER1Q12276 CYT2YKL087C 675 nt10.11□□□□□ -0.79
HER1Q12276 YLR235CYLR235C 399 nt10.11□□□□□ -0.79
HER1Q12276 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.1□□□□□ -0.79
HER1Q12276 PBP1YGR178C 2169 nt10.09□□□□□ -0.79
HER1Q12276 FTR1YER145C 1215 nt10.08□□□□□ -0.8
HER1Q12276 YGR259CYGR259C 441 nt10.08□□□□□ -0.8
HER1Q12276 BNA2YJR078W 1362 nt10.07□□□□□ -0.8
HER1Q12276 DIC1YLR348C 897 nt10.07□□□□□ -0.8
HER1Q12276 DUS1YML080W 1272 nt10.07□□□□□ -0.8
HER1Q12276 DDR2YOL052C-A 186 nt10.07□□□□□ -0.8
HER1Q12276 TRM5YHR070W 1500 nt10.06□□□□□ -0.8
HER1Q12276 YCL074WYCL074W 927 nt10.05□□□□□ -0.8
HER1Q12276 IRC24YIR036C 792 nt10.05□□□□□ -0.8
HER1Q12276 GAL1YBR020W 1587 nt10.05□□□□□ -0.8
HER1Q12276 YKL030WYKL030W 606 nt10.04□□□□□ -0.8
HER1Q12276 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.02□□□□□ -0.81
HER1Q12276 AGP1YCL025C 1902 nt10.01□□□□□ -0.81
HER1Q12276 CMP2YML057W 1815 nt10□□□□□ -0.81
HER1Q12276 TIM23YNR017W 669 nt9.99□□□□□ -0.81
HER1Q12276 MIC12YBR262C 321 nt9.98□□□□□ -0.81
HER1Q12276 ANP1YEL036C 1503 nt9.97□□□□□ -0.81
HER1Q12276 YLR179CYLR179C 606 nt9.94□□□□□ -0.82
HER1Q12276 FRE6YLL051C 2139 nt9.92□□□□□ -0.82
HER1Q12276 HHO1YPL127C 777 nt9.91□□□□□ -0.82
HER1Q12276 AQY1YPR192W 918 nt9.9□□□□□ -0.82
HER1Q12276 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.86□□□□□ -0.83
HER1Q12276 AHT1YHR093W 549 nt9.86□□□□□ -0.83
HER1Q12276 YPR064WYPR064W 420 nt9.86□□□□□ -0.83
HER1Q12276 STB1YNL309W 1263 nt9.85□□□□□ -0.83
HER1Q12276 FEN2YCR028C 1539 nt9.85□□□□□ -0.83
HER1Q12276 YAT1YAR035W 2064 nt9.84□□□□□ -0.83
HER1Q12276 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.84□□□□□ -0.83
HER1Q12276 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.84□□□□□ -0.83
HER1Q12276 SBA1YKL117W 651 nt9.82□□□□□ -0.84
HER1Q12276 NDI1YML120C 1542 nt9.82□□□□□ -0.84
HER1Q12276 XDJ1YLR090W 1380 nt9.81□□□□□ -0.84
HER1Q12276 SPC25YER018C 666 nt9.81□□□□□ -0.84
HER1Q12276 GPI16YHR188C 1833 nt9.8□□□□□ -0.84
HER1Q12276 STR3YGL184C 1398 nt9.8□□□□□ -0.84
HER1Q12276 TAD3YLR316C 969 nt9.8□□□□□ -0.84
HER1Q12276 YGR201CYGR201C 678 nt9.79□□□□□ -0.84
HER1Q12276 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.77□□□□□ -0.85
HER1Q12276 YIR016WYIR016W 798 nt9.77□□□□□ -0.85
HER1Q12276 PAU16YKL224C 372 nt9.76□□□□□ -0.85
HER1Q12276 HSL7YBR133C 2484 nt9.76□□□□□ -0.85
HER1Q12276 AQY2YLL052C 450 nt9.74□□□□□ -0.85
HER1Q12276 CCT4YDL143W 1587 nt9.74□□□□□ -0.85
HER1Q12276 VPS60YDR486C 690 nt9.73□□□□□ -0.85
HER1Q12276 DUT1YBR252W 444 nt9.73□□□□□ -0.85
HER1Q12276 RTN2YDL204W 1182 nt9.72□□□□□ -0.85
HER1Q12276 YFR018CYFR018C 1092 nt9.7□□□□□ -0.86
HER1Q12276 GDH3YAL062W 1374 nt9.67□□□□□ -0.86
HER1Q12276 ALG3YBL082C 1377 nt9.67□□□□□ -0.86
HER1Q12276 RRT5YFR032C 870 nt9.67□□□□□ -0.86
HER1Q12276 SWC5YBR231C 912 nt9.67□□□□□ -0.86
HER1Q12276 SPT20YOL148C 1815 nt9.67□□□□□ -0.86
HER1Q12276 BDH1YAL060W 1149 nt9.66□□□□□ -0.86
HER1Q12276 GOR1YNL274C 1053 nt9.65□□□□□ -0.86
HER1Q12276 AVT6YER119C 1347 nt9.64□□□□□ -0.87
HER1Q12276 PRE6YOL038W 765 nt9.63□□□□□ -0.87
HER1Q12276 YLR415CYLR415C 339 nt9.62□□□□□ -0.87
HER1Q12276 INA1YLR413W 2028 nt9.61□□□□□ -0.87
HER1Q12276 YSP3YOR003W 1437 nt9.59□□□□□ -0.87
HER1Q12276 RPC82YPR190C 1965 nt9.58□□□□□ -0.88
HER1Q12276 HIF1YLL022C 1158 nt9.54□□□□□ -0.88
HER1Q12276 PEX25YPL112C 1185 nt9.53□□□□□ -0.88
HER1Q12276 HEL2YDR266C 1920 nt9.52□□□□□ -0.88
HER1Q12276 YNL115CYNL115C 1935 nt9.52□□□□□ -0.89
HER1Q12276 ALD4YOR374W 1560 nt9.51□□□□□ -0.89
HER1Q12276 YFL066CYFL066C 1179 nt9.5□□□□□ -0.89
HER1Q12276 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.5□□□□□ -0.89
HER1Q12276 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.5□□□□□ -0.89
HER1Q12276 PLB1YMR008C 1995 nt9.48□□□□□ -0.89
HER1Q12276 PRM5YIL117C 957 nt9.48□□□□□ -0.89
HER1Q12276 RIM8YGL045W 1629 nt9.48□□□□□ -0.89
HER1Q12276 TIM17YJL143W 477 nt9.44□□□□□ -0.9
HER1Q12276 SHM2YLR058C 1410 nt9.42□□□□□ -0.9
HER1Q12276 NAT4YMR069W 858 nt9.42□□□□□ -0.9
HER1Q12276 ARP6YLR085C 1317 nt9.41□□□□□ -0.9
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