Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 ADH2YMR303C 1047 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 Q0255Q0255 1419 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 CWP1YKL096W 720 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 SOR2YDL246C 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 SOR1YJR159W 1074 nt10.1□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 SKG1YKR100C 1068 nt10.09□□□□□ -0.79
TY1A-BLQ12266 FRD1YEL047C 1413 nt10.08□□□□□ -0.8
TY1A-BLQ12266 YNR068CYNR068C 819 nt10.07□□□□□ -0.8
TY1A-BLQ12266 YCL042WYCL042W 360 nt10.05□□□□□ -0.8
TY1A-BLQ12266 LCP5YER127W 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1A-BLQ12266 SIM1YIL123W 1431 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1A-BLQ12266 SNF6YHL025W 999 nt10.03□□□□□ -0.8
TY1A-BLQ12266 BOR1YNL275W 1731 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 YGL188CYGL188C 174 nt10.01□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 BIO4YNR057C 714 nt10□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 SPP1YPL138C 1062 nt10□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 URH1YDR400W 1023 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 YOR169CYOR169C 465 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 HMT1YBR034C 1047 nt9.97□□□□□ -0.81
TY1A-BLQ12266 LYS4YDR234W 2082 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 ATP6Q0085 780 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 SWE1YJL187C 2460 nt9.95□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 YIH1YCR059C 777 nt9.94□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 YPL071CYPL071C 471 nt9.94□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 AIR1YIL079C 1083 nt9.93□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 RNQ1YCL028W 1218 nt9.91□□□□□ -0.82
TY1A-BLQ12266 YLL053CYLL053C 459 nt9.89□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 YPL168WYPL168W 1293 nt9.89□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 PTH1YHR189W 573 nt9.87□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 DIC1YLR348C 897 nt9.86□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 URE2YNL229C 1065 nt9.85□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.84□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.84□□□□□ -0.83
TY1A-BLQ12266 HSP60YLR259C 1719 nt9.83□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 CRR1YLR213C 1269 nt9.82□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 KTR3YBR205W 1215 nt9.82□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 ERF2YLR246W 1080 nt9.81□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.81□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 FTR1YER145C 1215 nt9.8□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 ATF2YGR177C 1608 nt9.8□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 YJL118WYJL118W 660 nt9.78□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 NEM1YHR004C 1341 nt9.78□□□□□ -0.84
TY1A-BLQ12266 GAL1YBR020W 1587 nt9.77□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 YLR235CYLR235C 399 nt9.77□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 YHM2YMR241W 945 nt9.77□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 TRM5YHR070W 1500 nt9.75□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 UME6YDR207C 2511 nt9.74□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 MIC10YCL057C-A 294 nt9.74□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.73□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 GLK1YCL040W 1503 nt9.72□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 TIM23YNR017W 669 nt9.72□□□□□ -0.85
TY1A-BLQ12266 YFL067WYFL067W 528 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 RTG1YOL067C 534 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 SNG1YGR197C 1644 nt9.71□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 HEM12YDR047W 1089 nt9.7□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 YKL030WYKL030W 606 nt9.69□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 YLR179CYLR179C 606 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 DDR2YOL052C-A 186 nt9.68□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 FUR4YBR021W 1902 nt9.67□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 STD1YOR047C 1335 nt9.66□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 ALG12YNR030W 1656 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 AQY1YPR192W 918 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 WSC2YNL283C 1512 nt9.65□□□□□ -0.86
TY1A-BLQ12266 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.64□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 YJL107CYJL107C 1164 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 STB1YNL309W 1263 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 CCA1YER168C 1641 nt9.63□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 ANP1YEL036C 1503 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 RAX1YOR301W 1308 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 AHT1YHR093W 549 nt9.62□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 SPC25YER018C 666 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 LSM12YHR121W 564 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 AST1YBL069W 1290 nt9.61□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 THP3YPR045C 1413 nt9.6□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 PHO92YDR374C 921 nt9.59□□□□□ -0.87
TY1A-BLQ12266 MCH5YOR306C 1566 nt9.58□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 YEL076CYEL076C 651 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 YLR464WYLR464W 651 nt9.57□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 YEL074WYEL074W 339 nt9.56□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 FEN2YCR028C 1539 nt9.56□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 PRP4YPR178W 1398 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 YHL044WYHL044W 708 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 YPR064WYPR064W 420 nt9.55□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 RSM23YGL129C 1353 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 VPS60YDR486C 690 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 PEX27YOR193W 1131 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 GPI16YHR188C 1833 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 CCT4YDL143W 1587 nt9.54□□□□□ -0.88
TY1A-BLQ12266 ALG3YBL082C 1377 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 TAD3YLR316C 969 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 AAC1YMR056C 930 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 YIR016WYIR016W 798 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 MRPL8YJL063C 717 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 MIC12YBR262C 321 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 DPS1YLL018C 1674 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 YLR036CYLR036C 612 nt9.48□□□□□ -0.89
TY1A-BLQ12266 HUA1YGR268C 597 nt9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.6 ms