Protein–RNA interactions for Protein: Q12161

PSH1, RING finger protein PSH1, yeastyeast

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSH1Q12161 PCH2YBR186W 1695 nt13.27□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 ATF2YGR177C 1608 nt13.25□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 YFL066CYFL066C 1179 nt13.24□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 BDH1YAL060W 1149 nt13.24□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 STB1YNL309W 1263 nt13.24□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 SPC25YER018C 666 nt13.23□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 ERF2YLR246W 1080 nt13.23□□□□□ -0.29
PSH1Q12161 YSP3YOR003W 1437 nt13.21□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 DDR2YOL052C-A 186 nt13.2□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 PEX25YPL112C 1185 nt13.2□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 CCT4YDL143W 1587 nt13.2□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 NCP1YHR042W 2076 nt13.19□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.19□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 GUT2YIL155C 1950 nt13.19□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 YFL067WYFL067W 528 nt13.18□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 CRR1YLR213C 1269 nt13.17□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 YLR415CYLR415C 339 nt13.16□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 GPI16YHR188C 1833 nt13.15□□□□□ -0.3
PSH1Q12161 YNL115CYNL115C 1935 nt13.14□□□□□ -0.31
PSH1Q12161 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.13□□□□□ -0.31
PSH1Q12161 VPS60YDR486C 690 nt13.12□□□□□ -0.31
PSH1Q12161 SWC5YBR231C 912 nt13.09□□□□□ -0.31
PSH1Q12161 ALG3YBL082C 1377 nt13.08□□□□□ -0.31
PSH1Q12161 LYS4YDR234W 2082 nt13.08□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 SBA1YKL117W 651 nt13.08□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 ANP1YEL036C 1503 nt13.08□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 FEN2YCR028C 1539 nt13.07□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 BOP3YNL042W 1191 nt13.06□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 SNG1YGR197C 1644 nt13.06□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 MIC10YCL057C-A 294 nt13.04□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 RTF1YGL244W 1677 nt13.03□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 HEM12YDR047W 1089 nt13.03□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 PIB2YGL023C 1908 nt13.02□□□□□ -0.32
PSH1Q12161 NAT4YMR069W 858 nt12.97□□□□□ -0.33
PSH1Q12161 YIR016WYIR016W 798 nt12.95□□□□□ -0.34
PSH1Q12161 VPS75YNL246W 795 nt12.94□□□□□ -0.34
PSH1Q12161 SPT8YLR055C 1809 nt12.94□□□□□ -0.34
PSH1Q12161 GLK1YCL040W 1503 nt12.93□□□□□ -0.34
PSH1Q12161 MIR1YJR077C 936 nt12.91□□□□□ -0.34
PSH1Q12161 MSF1YPR047W 1410 nt12.87□□□□□ -0.35
PSH1Q12161 THI74YDR438W 1113 nt12.86□□□□□ -0.35
PSH1Q12161 PTK1YKL198C 1989 nt12.85□□□□□ -0.35
PSH1Q12161 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.81□□□□□ -0.36
PSH1Q12161 TIM17YJL143W 477 nt12.8□□□□□ -0.36
PSH1Q12161 YGR139WYGR139W 339 nt12.78□□□□□ -0.36
PSH1Q12161 SHM2YLR058C 1410 nt12.77□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 YJL225CYJL225C 5277 nt12.75□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 BNA2YJR078W 1362 nt12.75□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 PAU7YAR020C 168 nt12.75□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 RPM1RPM1 483 nt12.75□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 MIC12YBR262C 321 nt12.75□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 XDJ1YLR090W 1380 nt12.74□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 DAT1YML113W 747 nt12.74□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 RAX1YOR301W 1308 nt12.71□□□□□ -0.37
PSH1Q12161 NIT1YIL164C 600 nt12.67□□□□□ -0.38
PSH1Q12161 SHB17YKR043C 816 nt12.67□□□□□ -0.38
PSH1Q12161 UBA4YHR111W 1323 nt12.66□□□□□ -0.38
PSH1Q12161 YFL054CYFL054C 1941 nt12.65□□□□□ -0.38
PSH1Q12161 SGT2YOR007C 1041 nt12.65□□□□□ -0.38
PSH1Q12161 GDH3YAL062W 1374 nt12.65□□□□□ -0.38
PSH1Q12161 HHO1YPL127C 777 nt12.63□□□□□ -0.39
PSH1Q12161 YGL034CYGL034C 366 nt12.62□□□□□ -0.39
PSH1Q12161 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.61□□□□□ -0.39
PSH1Q12161 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.61□□□□□ -0.39
PSH1Q12161 YDR010CYDR010C 333 nt12.61□□□□□ -0.39
PSH1Q12161 YGR201CYGR201C 678 nt12.6□□□□□ -0.39
PSH1Q12161 YSR3YKR053C 1215 nt12.57□□□□□ -0.4
PSH1Q12161 YMR244WYMR244W 1068 nt12.56□□□□□ -0.4
PSH1Q12161 XYL2YLR070C 1071 nt12.53□□□□□ -0.4
PSH1Q12161 AVT6YER119C 1347 nt12.52□□□□□ -0.41
PSH1Q12161 RET2YFR051C 1641 nt12.49□□□□□ -0.41
PSH1Q12161 MCH5YOR306C 1566 nt12.48□□□□□ -0.41
PSH1Q12161 GLR1YPL091W 1452 nt12.48□□□□□ -0.41
PSH1Q12161 PHO89YBR296C 1725 nt12.48□□□□□ -0.41
PSH1Q12161 CCA1YER168C 1641 nt12.46□□□□□ -0.41
PSH1Q12161 AGP1YCL025C 1902 nt12.46□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 NDI1YML120C 1542 nt12.46□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 RBG1YAL036C 1110 nt12.45□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 GOR1YNL274C 1053 nt12.44□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 DUT1YBR252W 444 nt12.44□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 YCR087WYCR087W 516 nt12.4□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 SWE1YJL187C 2460 nt12.4□□□□□ -0.42
PSH1Q12161 AIM45YPR004C 1035 nt12.38□□□□□ -0.43
PSH1Q12161 YCR102CYCR102C 1107 nt12.36□□□□□ -0.43
PSH1Q12161 NME1NME1 340 nt12.36□□□□□ -0.43
PSH1Q12161 SFA1YDL168W 1161 nt12.33□□□□□ -0.44
PSH1Q12161 COQ2YNR041C 1119 nt12.33□□□□□ -0.44
PSH1Q12161 MRP20YDR405W 792 nt12.31□□□□□ -0.44
PSH1Q12161 RBG2YGR173W 1107 nt12.31□□□□□ -0.44
PSH1Q12161 BOR1YNL275W 1731 nt12.25□□□□□ -0.45
PSH1Q12161 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.25□□□□□ -0.45
PSH1Q12161 NBP35YGL091C 987 nt12.24□□□□□ -0.45
PSH1Q12161 SHH4YLR164W 507 nt12.22□□□□□ -0.45
PSH1Q12161 DUS1YML080W 1272 nt12.21□□□□□ -0.45
PSH1Q12161 YMR226CYMR226C 804 nt12.18□□□□□ -0.46
PSH1Q12161 STR3YGL184C 1398 nt12.18□□□□□ -0.46
PSH1Q12161 TIR3YIL011W 810 nt12.17□□□□□ -0.46
PSH1Q12161 RPL4BYDR012W 1089 nt12.15□□□□□ -0.46
PSH1Q12161 RPL4AYBR031W 1089 nt12.15□□□□□ -0.46
PSH1Q12161 AQY2YLL052C 450 nt12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.7 ms