Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 GAL1YBR020W 1587 nt10.01□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 YKR040CYKR040C 504 nt10□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 BNA2YJR078W 1362 nt10□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 NAR1YNL240C 1476 nt9.99□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.99□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 DIC1YLR348C 897 nt9.99□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 YKR005CYKR005C 1578 nt9.98□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 WSC2YNL283C 1512 nt9.97□□□□□ -0.81
NEJ1Q06148 LPX1YOR084W 1164 nt9.96□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 YPR011CYPR011C 981 nt9.96□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 ANP1YEL036C 1503 nt9.94□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 DUS1YML080W 1272 nt9.93□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 AQY1YPR192W 918 nt9.92□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 YCL074WYCL074W 927 nt9.91□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 MIC12YBR262C 321 nt9.91□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.82
NEJ1Q06148 SNF1YDR477W 1902 nt9.9□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.89□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.89□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.89□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.89□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.89□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 YGR259CYGR259C 441 nt9.88□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 AGP1YCL025C 1902 nt9.88□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 IRC24YIR036C 792 nt9.86□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.84□□□□□ -0.83
NEJ1Q06148 CYT2YKL087C 675 nt9.83□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 STB1YNL309W 1263 nt9.83□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 HHO1YPL127C 777 nt9.83□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 FEN2YCR028C 1539 nt9.82□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 SPC25YER018C 666 nt9.82□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 PBP1YGR178C 2169 nt9.82□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 GPI16YHR188C 1833 nt9.81□□□□□ -0.84
NEJ1Q06148 YGR201CYGR201C 678 nt9.76□□□□□ -0.85
NEJ1Q06148 YIR016WYIR016W 798 nt9.74□□□□□ -0.85
NEJ1Q06148 TIM23YNR017W 669 nt9.74□□□□□ -0.85
NEJ1Q06148 YLR179CYLR179C 606 nt9.73□□□□□ -0.85
NEJ1Q06148 YLR235CYLR235C 399 nt9.72□□□□□ -0.85
NEJ1Q06148 VPS60YDR486C 690 nt9.71□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 XDJ1YLR090W 1380 nt9.71□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 PTH1YHR189W 573 nt9.7□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 CCT4YDL143W 1587 nt9.69□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.69□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 STR3YGL184C 1398 nt9.68□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 SWC5YBR231C 912 nt9.66□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 CMP2YML057W 1815 nt9.66□□□□□ -0.86
NEJ1Q06148 ALG3YBL082C 1377 nt9.63□□□□□ -0.87
NEJ1Q06148 AHT1YHR093W 549 nt9.63□□□□□ -0.87
NEJ1Q06148 RTN2YDL204W 1182 nt9.62□□□□□ -0.87
NEJ1Q06148 AQY2YLL052C 450 nt9.61□□□□□ -0.87
NEJ1Q06148 GOR1YNL274C 1053 nt9.6□□□□□ -0.87
NEJ1Q06148 DUT1YBR252W 444 nt9.6□□□□□ -0.87
NEJ1Q06148 AVT6YER119C 1347 nt9.58□□□□□ -0.88
NEJ1Q06148 RPM1RPM1 483 nt9.58□□□□□ -0.88
NEJ1Q06148 YPR064WYPR064W 420 nt9.56□□□□□ -0.88
NEJ1Q06148 NDI1YML120C 1542 nt9.55□□□□□ -0.88
NEJ1Q06148 YAT1YAR035W 2064 nt9.54□□□□□ -0.88
NEJ1Q06148 GDH3YAL062W 1374 nt9.52□□□□□ -0.88
NEJ1Q06148 YKL030WYKL030W 606 nt9.52□□□□□ -0.89
NEJ1Q06148 SPP1YPL138C 1062 nt9.5□□□□□ -0.89
NEJ1Q06148 TAD3YLR316C 969 nt9.47□□□□□ -0.89
NEJ1Q06148 MOT3YMR070W 1473 nt9.42□□□□□ -0.9
NEJ1Q06148 SPT20YOL148C 1815 nt9.41□□□□□ -0.9
NEJ1Q06148 HSL7YBR133C 2484 nt9.4□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 SHM2YLR058C 1410 nt9.39□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 INA1YLR413W 2028 nt9.39□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 PLB1YMR008C 1995 nt9.38□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 TIM17YJL143W 477 nt9.37□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 HIF1YLL022C 1158 nt9.37□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 YLR415CYLR415C 339 nt9.37□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 DAT1YML113W 747 nt9.37□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 ALD4YOR374W 1560 nt9.37□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 BDH1YAL060W 1149 nt9.35□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 ARP6YLR085C 1317 nt9.34□□□□□ -0.91
NEJ1Q06148 PRM5YIL117C 957 nt9.33□□□□□ -0.92
NEJ1Q06148 RPC82YPR190C 1965 nt9.32□□□□□ -0.92
NEJ1Q06148 YCR102CYCR102C 1107 nt9.31□□□□□ -0.92
NEJ1Q06148 NBP35YGL091C 987 nt9.31□□□□□ -0.92
NEJ1Q06148 NIT1YIL164C 600 nt9.27□□□□□ -0.93
NEJ1Q06148 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.24□□□□□ -0.93
NEJ1Q06148 SAM35YHR083W 990 nt9.23□□□□□ -0.93
NEJ1Q06148 SGT2YOR007C 1041 nt9.23□□□□□ -0.93
NEJ1Q06148 ZRT3YKL175W 1512 nt9.21□□□□□ -0.93
NEJ1Q06148 UTR1YJR049C 1593 nt9.21□□□□□ -0.93
NEJ1Q06148 YSP3YOR003W 1437 nt9.21□□□□□ -0.94
NEJ1Q06148 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.18□□□□□ -0.94
NEJ1Q06148 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.18□□□□□ -0.94
NEJ1Q06148 LSC2YGR244C 1284 nt9.16□□□□□ -0.94
NEJ1Q06148 GAP1YKR039W 1809 nt9.15□□□□□ -0.94
NEJ1Q06148 Q0182Q0182 405 nt9.15□□□□□ -0.94
NEJ1Q06148 HEL2YDR266C 1920 nt9.13□□□□□ -0.95
NEJ1Q06148 RIM8YGL045W 1629 nt9.13□□□□□ -0.95
NEJ1Q06148 TIR3YIL011W 810 nt9.13□□□□□ -0.95
NEJ1Q06148 RTG1YOL067C 534 nt9.11□□□□□ -0.95
NEJ1Q06148 MUP1YGR055W 1725 nt9.09□□□□□ -0.95
NEJ1Q06148 YNL115CYNL115C 1935 nt9.09□□□□□ -0.95
NEJ1Q06148 YGL114WYGL114W 2178 nt9.08□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 YJL067WYJL067W 351 nt9.08□□□□□ -0.96
NEJ1Q06148 PRO1YDR300C 1287 nt9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 214.3 ms